RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 HMGCLL1Q8TB92 370 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACTL9Q8TC94 416 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SHC3Q92529 594 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIGSQ96S52 555 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TINAGQ9UJW2 476 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TPP1O14773 563 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GREM1O60565 184 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 APOA1P02647 267 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITGB3P05106 788 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 HMGN1P05114 100 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 FASP25445 335 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 DNAJB1P25685 340 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 S100A12P80511 92 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 EPS8Q12929 822 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR44Q5JSH3 913 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LAYNQ6UX15 382 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TLK2Q86UE8 772 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDH26Q8IXH8 852 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF384Q8TF68 577 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 COA7Q96BR5 231 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC39Q96DD0 335 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDCA5Q96FF9 252 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SAMD11Q96NU1 681 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB20Q9NX57 234 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 EHD3Q9NZN3 535 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 COL20A1Q9P218 1284 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCN7AQ01118 1682 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 DHRS12A0PJE2 317 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC154A6NI56 674 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 HACD1B0YJ81 288 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 E5RI56 91 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTGES3LE9PB15 166 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RGS5O15539 181 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRID2O43424 1007 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MT-ND1P03886 318 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 C2P06681 752 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 POU2F1P14859 743 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNNI3P19429 210 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRPAP1P30533 357 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 HTR7P34969 479 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAP2K4P45985 399 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MFAP3P55082 362 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNK1Q13470 666 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 DPYSL3Q14195 570 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 STARD3Q14849 445 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBTB33Q86T24 672 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ST8SIA4Q92187 359 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEMA4DQ92854 862 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RADILQ96JH8 1075 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPA2Q9H2U2 334 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCN4AP35499 1836 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 METTL15A6NJ78 407 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TISP43B9A030 160 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 F8W810 466 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SMLR1H3BR10 107 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 AGRPO00253 132 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms