RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 MTA2O94776 668 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 CPP00450 1065 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 CSF2P04141 144 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ALPPL2P10696 532 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ITIH1P19827 911 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGAP25P42331 645 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MMP13P45452 471 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 LIG3P49916 1009 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 THOP1P52888 689 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 GALNT2Q10471 571 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PTK2BQ14289 1009 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MESDQ14696 234 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRC14Q15048 493 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 AGERQ15109 404 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 IRF4Q15306 451 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MARC1Q5VT66 337 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 LIPIQ6XZB0 460 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MACC1Q6ZN28 852 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 DTX1Q86Y01 620 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 JAMLQ86YT9 394 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PGBD5Q8N414 524 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 FAF2Q96CS3 445 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MGME1Q9BQP7 344 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 KLF15Q9UIH9 416 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 INTUQ9ULD6 942 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 SVILO95425 2214 aa6.44□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 VPS13CQ709C8 3753 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF487B1APH4 448 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PLD2O14939 933 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 SCAMP1O15126 338 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MATN3O15232 486 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 AQP9O43315 295 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PRAMEF10O60809 474 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 DIAPH2O60879 1101 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ELFN1P0C7U0 828 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 LIPCP11150 499 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 JUNDP17535 347 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MX2P20592 715 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 KDELR1P24390 212 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 CCNCP24863 283 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 NFKBIAP25963 317 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PEX5P50542 639 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ARSDP51689 593 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MAXP61244 160 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 RALGDSQ12967 914 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MTM1Q13496 603 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TCEAL1Q15170 157 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MANEAQ5SRI9 462 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 FHL5Q5TD97 284 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 BORAQ6PGQ7 559 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 DPPA4Q7L190 304 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 VSIG1Q86XK7 387 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TEX26Q8N6G2 289 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PQLC3Q8N755 202 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TC2NQ8N9U0 490 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 RAPGEF5Q92565 580 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 MAML1Q92585 1016 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 FATE1Q969F0 183 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 HDAC11Q96DB2 347 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TBATAQ96M53 351 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 TSGA13Q96PP4 275 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 RNF157Q96PX1 679 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTDSPL-208ENST00000486978 NOD2Q9HC29 1040 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms