RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483417.1

HMG20B-210, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 3

Gene HMG20B, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-210ENST00000483417 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.61□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 DKK4Q9UBT3 224 aa9.61□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.61□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 PCYOX1Q9UHG3 505 aa9.61□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.61□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 KCTD3Q9Y597 815 aa9.61□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 TRPM6Q9BX84 2022 aa9.61□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 USP24Q9UPU5 2620 aa9.61□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.61□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 A0A0J9YYE9 177 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 FAM149AA5PLN7 773 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 TP73O15350 636 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 RAD51CO43502 376 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 SIGLEC6O43699 453 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 BUD23O43709 281 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 SDC3O75056 442 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 SOCS5O75159 536 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 PIAS2O75928 621 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 STK10O94804 968 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 NDST3O95803 873 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CPP00450 1065 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 TRBC1P01850 177 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 TUBB4AP04350 444 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CDK4P11802 303 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CKMT2P17540 419 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 ACP1P24666 158 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 FNTAP49354 379 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 LIG3P49916 1009 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 GEMP55040 296 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 SLC7A5Q01650 507 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 GPS1Q13098 491 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 ILKQ13418 452 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 MTM1Q13496 603 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 FZD2Q14332 565 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 GRM3Q14832 879 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 SLC1A5Q15758 541 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 DENND2CQ68D51 928 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 BRAT1Q6PJG6 821 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 LIPIQ6XZB0 460 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CCDC89Q8N998 374 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 PWWP2AQ96N64 755 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 PAK5Q9P286 719 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 KLF15Q9UIH9 416 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.6□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 A6NNZ2 444 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 AVILO75366 819 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 RFPL3O75679 317 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 ANXA9O76027 345 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 EPOP01588 193 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CSF2P04141 144 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 XPAP23025 273 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CA5AP35218 305 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 SUOXP51687 545 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CLDN6P56747 220 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 SGCGQ13326 291 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 MPP3Q13368 585 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 SEMA5AQ13591 1074 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 PRPSAP1Q14558 356 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CNGA3Q16281 694 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CERCAMQ5T4B2 595 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 Q6ZVL8 140 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 DPPA4Q7L190 304 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 JAMLQ86YT9 394 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 PAF1Q8N7H5 531 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 OR4C6Q8NH72 309 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 MDM1Q8TC05 714 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CPT1BQ92523 772 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 SPOCK2Q92563 424 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CARD6Q9BX69 1037 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 TRIM31Q9BZY9 425 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CD84Q9UIB8 345 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 SNX24Q9Y343 169 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 U3KQA8 63 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HMG20B-210ENST00000483417 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.58□□□□□ -0.88
HMG20B-210ENST00000483417 FREM2Q5SZK8 3169 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms