RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 MOSPD1Q9UJG1 213 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 DPYSL4O14531 572 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PSMB9P28065 219 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 MPP1Q00013 466 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB6Q15916 424 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 BNIPLQ7Z465 357 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF567Q8N184 647 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CDH7Q9ULB5 785 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CELF2O95319 508 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CD4P01730 458 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO48Q5FWF7 155 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SPANXN3Q5MJ09 141 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 LDLRAD1Q5T700 205 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA0319Q5VV43 1072 aa16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 RRN3P2A6NIE6 340 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TBX1O43435 398 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 NMBRP28336 390 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PLA2G16P53816 162 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM32Q13049 653 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 INAVAQ3KP66 663 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SMUG1Q53HV7 270 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TMTC4Q5T4D3 741 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 FAM117BQ6P1L5 589 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 UNC93AQ86WB7 457 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 FUNDC2Q9BWH2 189 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 VPS28Q9UK41 221 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 NRCAMQ92823 1304 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PIRO00625 290 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 GUCY1B2O75343 617 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SEC24AO95486 1093 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 POMCP01189 267 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 STMN1P16949 149 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ERCC2P18074 760 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CLCNKBP51801 687 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 GJA9P57773 515 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TPI1P60174 286 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 C1QTNF8P60827 252 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SYTL1Q8IYJ3 562 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TUBGCP3Q96CW5 907 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 GIMAP4Q9NUV9 329 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 GDAP2Q9NXN4 497 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 FZD10Q9ULW2 581 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TCAF1Q9Y4C2 921 aa16.19■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 COL1A2P08123 1366 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0J9YYE9 177 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 NPR3P17342 541 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PSEN2P49810 448 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TNK2Q07912 1038 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 NFYCQ13952 458 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A52Q3SY17 297 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SV2CQ496J9 727 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 RABL3Q5HYI8 236 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC20AQ6ZU45 233 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ANKFN1Q8N957 763 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM30AQ9NV96 361 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SLC4A1P02730 911 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 APOA4P06727 396 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 BMP2P12643 396 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 VBP1P61758 197 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SQLEQ14534 574 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 MEP1AQ16819 746 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PPP2R2DQ66LE6 453 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PLD3Q8IV08 490 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 KDM1BQ8NB78 822 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SENP8Q96LD8 212 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 A8MV72 311 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 H0YJX3 145 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 H3BMM5 538 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 NOBOXO60393 691 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ECT2LQ008S8 904 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 OXA1LQ15070 435 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SLC36A3Q495N2 470 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 C4orf22Q6V702 233 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 VPS33AQ96AX1 596 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 FAR2Q96K12 515 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 FTHL17Q9BXU8 183 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 DUSP16Q9BY84 665 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 AP5M1Q9H0R1 490 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 STAP1Q9ULZ2 295 aa16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PQ67 120 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 RAD51BO15315 384 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms