RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	TTC25	Q96NG3	672 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	GBP5	Q96PP8	586 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	VCX3B	Q9H321	246 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	DNAJC18	Q9H819	358 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PPCS	Q9HAB8	311 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ASIC5	Q9NY37	505 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SENP1	Q9P0U3	644 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SCN4A	P35499	1836 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ARID2	Q68CP9	1835 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	RASA4B	C9J798	803 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983		H0Y3Z8	333 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	NDC80	O14777	642 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ZBTB5	O15062	677 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	P4HA2	O15460	535 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	TGFB1I1	O43294	461 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	RASA4	O43374	803 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC22	O60826	627 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	RSPH10B	P0C881	870 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	T-ENOL	P0DO92	83 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CETP	P11597	493 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	GM2A	P17900	193 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ADORA2A	P29274	412 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	BTD	P43251	543 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PSMC4	P43686	418 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	GPSM2	P81274	684 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC34A1	Q06495	639 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	MCL1	Q07820	350 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF543	Q08ER8	600 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	AP1B1	Q10567	949 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CETN1	Q12798	172 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	DNAJC3	Q13217	504 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SNX1	Q13596	522 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	MYBPC2	Q14324	1141 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	TNIP1	Q15025	636 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	RCN1	Q15293	331 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC15A2	Q16348	729 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	LY6K	Q17RY6	165 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983		Q4G0T1	1027 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CBWD6	Q4V339	395 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	HHAT	Q5VTY9	493 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	BRINP3	Q76B58	766 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	TRABD2A	Q86V40	505 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PALB2	Q86YC2	1186 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	DENND1C	Q8IV53	801 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	STMN2	Q93045	179 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF653	Q96CK0	615 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	COQ8B	Q96D53	544 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM20A	Q96MK3	541 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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