RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	TTC3	P53804	2025 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM247	A6NEH6	219 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	OAZ2	O95190	189 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	LDHC	P07864	332 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	HOXB2	P14652	356 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	TNFSF8	P32971	234 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	MVD	P53602	400 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	GSTO1	P78417	241 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	FHL1	Q13642	323 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	COG2	Q14746	738 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	PCGF5	Q86SE9	256 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	PELI3	Q8N2H9	469 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	DPP10	Q8N608	796 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	ASB5	Q8WWX0	329 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	WAC	Q9BTA9	647 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	UPB1	Q9UBR1	384 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF292	O60281	2723 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	ELP1	O95163	1332 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	C17orf100	A8MU93	164 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	FLOT1	O75955	427 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	METTL18	O95568	372 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	KLKB1	P03952	638 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	KCNA5	P22460	613 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	DDIT3	P35638	169 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	ARHGAP8	P85298	464 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080		Q5PR19	223 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	AADACL2	Q6P093	401 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	PARM1	Q6UWI2	310 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	SCAI	Q8N9R8	606 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	KDM1B	Q8NB78	822 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	MEIS3	Q99687	375 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	IFT27	Q9BW83	186 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	ISCU	Q9H1K1	167 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	MROH8	Q9H579	483 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	RIPK3	Q9Y572	518 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080		A0A0A0MQY5	61 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	GAGE12J	A6NER3	117 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	INSIG1	O15503	277 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	DCX	O43602	365 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	TMCC1	O94876	653 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	SNHG28	P0DPA3	235 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	AKR1B1	P15121	316 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	PRKCH	P24723	683 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	TMPRSS3	P57727	454 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	GABPA	Q06546	454 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	ACVR2B	Q13705	512 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	PKP1	Q13835	747 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	WDR63	Q8IWG1	891 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	FAR1	Q8WVX9	515 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	COG8	Q96MW5	612 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	FRG2B	Q96QU4	278 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49
RBM17-208	ENST00000467080	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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