RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	TPP1	O14773	563 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	AQP9	O43315	295 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	CP	P00450	1065 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC175	P0C221	793 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF30	P17039	623 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	TEAD1	P28347	426 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	TRAF2	Q12933	501 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	MTM1	Q13496	603 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	LIPI	Q6XZB0	460 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245		Q6ZSR6	202 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PEX26	Q7Z412	305 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	RFX6	Q8HWS3	928 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	CNTD1	Q8N815	330 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	CCNY	Q8ND76	341 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	OR13H1	Q8NG92	308 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	KRT35	Q92764	455 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	P3H4	Q92791	437 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	HES6	Q96HZ4	224 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	TEKT5	Q96M29	485 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	SPAST	Q9UBP0	616 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	GGT7	Q9UJ14	662 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	AMFR	Q9UKV5	643 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A0J9YYE9	177 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	POM121B	A6NF01	834 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PLD2	O14939	933 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	NEBL	O76041	1014 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	EPO	P01588	193 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	TRBC1	P01850	177 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	HLA-DQB2	P05538	268 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PYGL	P06737	847 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	GP1BB	P13224	206 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	JUND	P17535	347 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	VIPR1	P32241	457 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	LIG3	P49916	1009 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	MAX	P61244	160 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	CCZ1B	P86790	482 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBTB17	Q13105	803 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PTK2B	Q14289	1009 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	NOMO1	Q15155	1222 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	TEX44	Q53QW1	395 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	MANEA	Q5SRI9	462 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	GUSBP11	Q6P575	273 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	USP45	Q70EL2	814 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	LMX1A	Q8TE12	382 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	ALG3	Q92685	438 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	KLK6	Q92876	244 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	DESI2	Q9BSY9	194 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	FZD3	Q9NPG1	666 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	ITM2B	Q9Y287	266 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	FLNC	Q14315	2725 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNK1	O00180	336 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	RAD51B	O15315	384 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	EFS	O43281	561 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	SUV39H1	O43463	412 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	MMP20	O60882	483 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	TJP3	O95049	919 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	MAP3K6	O95382	1288 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PRL	P01236	227 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	JCHAIN	P01591	159 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	CSF2	P04141	144 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	ANXA6	P08133	673 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	MMP2	P08253	660 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	ELFN1	P0C7U0	828 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	JMJD7	P0C870	316 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	GIMD1	P0DJR0	217 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	LIPC	P11150	499 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	MYF5	P13349	255 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	IGFALS	P35858	605 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM23	P36406	574 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-223	ENST00000466245	THOP1	P52888	689 aa		10.05	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms