RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 OR2AG1Q9H205 316 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 TRPV5Q9NQA5 729 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 IL37Q9NZH6 218 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 MYH10P35580 1976 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF839A8K0R7 811 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 ISM1B1AKI9 464 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 OPA1O60313 960 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 NDUFV2P19404 249 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 MC4RP32245 332 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 PEX5P50542 639 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 CUL1Q13616 776 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 NAA25Q14CX7 972 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 NEPROQ6NW34 567 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 KDM1BQ8NB78 822 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 VWCEQ96DN2 955 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1B0GVT2 93 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 BTNL10A8MVZ5 291 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 ANHXE9PGG2 379 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 EBAG9O00559 213 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 DCLK1O15075 740 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 ITGB7P26010 798 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 MGAT1P26572 445 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 GRIA4P48058 902 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 OVGP1Q12889 678 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 USP30Q70CQ3 517 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 AMZ2Q86W34 360 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 RBFAQ8N0V3 343 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 TMIEQ8NEW7 156 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 CYTH2Q99418 400 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 PKMYT1Q99640 499 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 MAP10Q9P2G4 905 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 DRGXA6NNA5 263 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 SLC7A4O43246 635 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 PRAMEF1O95521 474 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 ESRRBO95718 433 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 COL9A1P20849 921 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 PRKCHP24723 683 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 CD27P26842 260 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 FOXM1Q08050 763 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 RPS6KA2Q15349 733 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF470Q6ECI4 717 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 NADSYN1Q6IA69 706 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 CDC26Q8NHZ8 85 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 OR2AG2A6NM03 316 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 AGTP01019 485 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 GALNT2Q10471 571 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 GAB3Q8WWW8 586 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 HDAC10Q969S8 669 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 VPS50Q96JG6 964 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 MRGPRX1Q96LB2 322 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 NLNQ9BYT8 704 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 CD274Q9NZQ7 290 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 SHISA7A6NL88 538 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 YKT6O15498 198 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 ZBTB14O43829 449 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 SPAG6O75602 509 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 HLA-DQB2P05538 268 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 TSHRP16473 764 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 SKP1P63208 163 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 SPIDRQ14159 915 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 LRRC66Q68CR7 880 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 IRGCQ6NXR0 463 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 NEK5Q6P3R8 708 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-215ENST00000462256 CYB5D1Q6P9G0 228 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms