RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 OR2T12Q8NG77 320 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 FCRL5Q96RD9 977 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 MAGEH1Q9H213 219 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 MYH6P13533 1939 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 KRT87PA6NCN2 255 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 MAPKAPK2P49137 400 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 INCA1Q0VD86 236 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 XKR6Q5GH73 641 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 DLK2Q6UY11 383 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CROCCP3Q8IVE0 287 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 OR8H2Q8N162 312 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 NELL1Q92832 810 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PSMG2Q969U7 264 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PANX1Q96RD7 426 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF358Q9NW07 568 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 POMPQ9Y244 141 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 WASF2Q9Y6W5 498 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RFXANKO14593 260 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ACSL4O60488 711 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 IL10RBQ08334 325 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 MTERF3Q96E29 417 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 HAPLN3Q96S86 360 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ETS2P15036 469 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CLCQ05315 142 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SUSD6Q92537 303 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ITCHQ96J02 903 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 HMG20AQ9NP66 347 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 IRAK2O43187 625 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PHKG1Q16816 387 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CHADLQ6NUI6 762 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 OR7D4Q8NG98 312 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RNF39Q9H2S5 420 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 VPS51Q9UID3 782 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 KLF11O14901 512 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SYN3O14994 580 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CREMQ03060 361 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SLC18A2Q05940 514 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 KRT78Q8N1N4 520 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 MYH10P35580 1976 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 MYH8P13535 1937 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ELNP15502 786 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SLC1A2P43004 574 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PPM1MQ96MI6 270 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RAB26Q9ULW5 256 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 GOT2P00505 430 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 GNPDA1P46926 289 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RNF220Q5VTB9 566 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CNTN3Q9P232 1028 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PEX2P28328 305 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 GABRR2P28476 465 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 HCAR3P49019 387 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ACTR3P61158 418 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ABRQ12979 859 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TRAF3Q13114 568 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RFX4Q33E94 735 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CACUL1Q86Y37 369 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 FADS3Q9Y5Q0 445 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 RGPD5Q99666 1765 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 DPPA5A6NC42 116 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 CHRNA4P43681 627 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 REP15Q6BDI9 236 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 BRSK1Q8TDC3 778 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-205ENST00000460170 BTBD9Q96Q07 612 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms