RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 IL10RBQ08334 325 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 BIRC2Q13490 618 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 DPYSL3Q14195 570 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ZNF235Q14590 738 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TGIF1Q15583 401 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 MAP9Q49MG5 647 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 COLEC12Q5KU26 742 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 PHF19Q5T6S3 580 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 AFMIDQ63HM1 303 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 BRAT1Q6PJG6 821 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TAF8Q7Z7C8 310 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 PIM3Q86V86 326 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 MAP7D3Q8IWC1 876 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 GPR156Q8NFN8 814 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 GPBAR1Q8TDU6 330 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 APOOQ9BUR5 198 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TUBD1Q9UJT1 453 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 UNC13CQ8NB66 2214 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 CHD5Q8TDI0 1954 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 BTNL10A8MVZ5 291 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TNFRSF10CO14798 259 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 PRAMEF10O60809 474 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 CPNE6O95741 557 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ITGB6P18564 788 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 NFKBIAP25963 317 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 MAPK10P53779 464 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 KIAA1024LP59773 190 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 INPP5AQ14642 412 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 PDK2Q15119 407 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TBR1Q16650 682 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 UGP2Q16851 508 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 BORAQ6PGQ7 559 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 SPRED1Q7Z699 444 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 FAM46DQ8NEK8 389 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 USP7Q93009 1102 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 CATSPER2Q96P56 530 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ZNF670Q9BS34 389 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 GOLPH3Q9H4A6 298 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 KCTD5Q9NXV2 234 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 LRIT1Q9P2V4 623 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 RNF215Q9Y6U7 377 aa11.68□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 SCN8AQ9UQD0 1980 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 KIF5CO60282 957 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 MTA2O94776 668 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TIMP2P16035 220 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 COMTP21964 271 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 KDELR1P24390 212 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 RGRP47804 291 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 SCNN1BP51168 640 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ARSEP51690 589 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 GNG11P61952 73 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TLE1Q04724 770 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ITKQ08881 620 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 SLC10A7Q0GE19 358 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 WSCD2Q2TBF2 565 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ZNF569Q5MCW4 686 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 OGFOD3Q6PK18 319 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 SRLQ86TD4 932 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 DTX1Q86Y01 620 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 RFX6Q8HWS3 928 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 RHOT1Q8IXI2 618 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 BBS5Q8N3I7 341 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 OR56A4Q8NGH8 313 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 RAPGEF5Q92565 580 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAME-210ENST00000442481 DPEP2Q9H4A9 486 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms