RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 CYP51A1Q16850 503 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 SPRYD7Q5W111 196 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF773Q6PK81 442 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 L3HYPDHQ96EM0 354 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 FCRL5Q96RD9 977 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 SUPT7LO94864 414 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 CTSHP09668 335 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 FOXM1Q08050 763 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 NEPROQ6NW34 567 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 MIER2Q8N344 545 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 LPPQ93052 612 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 SEPT3Q9UH03 358 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 CEP350Q5VT06 3117 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 INPP4BO15327 924 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 SEC14L2O76054 403 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 TSPAN8P19075 237 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 CLCN5P51795 746 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ADAM17P78536 824 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 MAP2K5Q13163 448 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 SLC14A2Q15849 920 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF678Q5SXM1 525 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 LIMS2Q7Z4I7 341 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC58Q96CX6 371 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 UBXN10Q96LJ8 280 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 GAD1Q99259 594 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 DDIT4Q9NX09 232 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 SNAP29O95721 258 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 TUBA3CQ13748 450 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 FAM35AQ86V20 835 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 SENP8Q96LD8 212 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 OR12D3Q9UGF7 316 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF639Q9UID6 485 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 TCRBV5S2A0A599 114 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 H0YAE9 185 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 CLPXO76031 633 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 LRIG2O94898 1065 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 MATN4O95460 622 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L7P0C7H9 530 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 RXRGP48443 463 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 GNA12Q03113 381 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 PLCL1Q15111 1095 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 COQ5Q5HYK3 327 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 LEMD2Q8NC56 503 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 FANCEQ9HB96 536 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 GLOD4Q9HC38 313 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ANAPC2Q9UJX6 822 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 LDLRP01130 860 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 UMPSP11172 480 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 NCAM1P13591 858 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 ADRA1AP35348 466 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 MAPK10P53779 464 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 GEMP55040 296 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-206ENST00000436282 DAOAP59103 153 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms