RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428519.1

RBMS1-206, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-206ENST00000428519 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 KCNMB4Q86W47 210 aa8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 NETO2Q8NC67 525 aa8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 INPP5DQ92835 1189 aa8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 SH3KBP1Q96B97 665 aa8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 HDAC11Q96DB2 347 aa8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 C9orf72Q96LT7 481 aa8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.047e-6■■■■□ 21.6
RBMS1-206ENST00000428519 DNAI1Q9UI46 699 aa8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 A0A1B0GUH1 482 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 A6NL46 340 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 E2F3O00716 465 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 TMEM63AO94886 807 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 TIAF1O95411 115 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 ERBB2P04626 1255 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 COX6B1P14854 86 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 CD1EP15812 388 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 RHOQP17081 205 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 SSTR2P30874 369 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 GFERP55789 205 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 CDK3Q00526 305 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 NFATC2Q13469 925 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 CUL4AQ13619 759 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 ZNF235Q14590 738 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 CYTH1Q15438 398 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 MANEALQ5VSG8 457 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 IYDQ6PHW0 289 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 MED25Q71SY5 747 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 BNIPLQ7Z465 357 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 CDH24Q86UP0 819 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 PPP1R3BQ86XI6 285 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 DNAAF5Q86Y56 855 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 RELTQ969Z4 430 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 COQ10AQ96MF6 247 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 FCRL4Q96PJ5 515 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 TBCBQ99426 244 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 ACP6Q9NPH0 428 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 LHX3Q9UBR4 397 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 PCDHA7Q9UN72 937 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.55□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 THAP12O43422 761 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 RAMP2O60895 175 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 KRT5P13647 590 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 TEAD1P28347 426 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 HTR1EP28566 365 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 SULT1E1P49888 294 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 SEPHS1P49903 392 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 LRP8Q14114 963 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 ACOX1Q15067 660 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 PYCR3Q53H96 274 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 CFAP58Q5T655 872 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 Q6ZS92 163 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 DPPA4Q7L190 304 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 FJX1Q86VR8 437 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 ECHDC3Q96DC8 303 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 EXOC2Q96KP1 924 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 OR2M4Q96R27 311 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 KLC2Q9H0B6 622 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 KCTD5Q9NXV2 234 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 OGFRQ9NZT2 677 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 OR12D3Q9UGF7 316 aa8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RBMS1-206ENST00000428519 NEU3Q9UQ49 428 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.9 ms