RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 IKZF3Q9UKT9 509 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 RFXANKO14593 260 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MYL12BO14950 172 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 AMHP03971 560 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ALOX5P09917 674 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIQKQ629K1 86 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PDSS2Q86YH6 399 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 POC5Q8NA72 575 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 HM13Q8TCT9 377 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFAND2BQ8WV99 257 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.211e-8■■■□□ 15.3
CTDSP2-201ENST00000398073 ABCB10Q9NRK6 738 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 YJEFN3A6XGL0 299 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 RFPL1O75677 317 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 AP5B1Q2VPB7 878 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PDPRQ8NCN5 879 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 OR4K2Q8NGD2 314 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PCED1BQ96HM7 432 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CLCA2Q9UQC9 943 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TIAM2Q8IVF5 1701 aa16.35■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC1A2P43004 574 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF132P52740 706 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SP2Q02086 613 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CEP78Q5JTW2 689 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TREML1Q86YW5 311 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 RBFAQ8N0V3 343 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PHTF2Q8N3S3 785 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMA8Q8TAA3 256 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 STARD7Q9NQZ5 370 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SH3GLB1Q9Y371 365 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 AQP12BA6NM10 295 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TLR5O60602 858 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TULP3O75386 442 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MTHFRP42898 656 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGA1P56199 1179 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 NADK2Q4G0N4 442 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 EPGNQ6UW88 154 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 AQP12AQ8IXF9 295 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CRYBG2Q8N1P7 616 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ABHD8Q96I13 439 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PANX1Q96RD7 426 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 FCRL5Q96RD9 977 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CIDEBQ9UHD4 219 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 MYL12AP19105 171 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ALDH9A1P49189 494 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SMYD5Q6GMV2 418 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 HIPK1Q86Z02 1210 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ATL1Q8WXF7 558 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PROX1Q92786 737 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHAC1Q9H158 963 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 KLHL28Q9NXS3 571 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CORO2BQ9UQ03 480 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 GRIN3BO60391 1043 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 DSC2Q02487 901 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CRTC3Q6UUV7 619 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PQLC3Q8N755 202 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 STRA6Q9BX79 667 aa16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1W2PQH9 124 aa16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 UROSP10746 265 aa16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 DBTP11182 482 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 GNPDA1P46926 289 aa16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PCLAFQ15004 111 aa16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM63Q969Q1 353 aa16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 CNTN3Q9P232 1028 aa16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
CTDSP2-201ENST00000398073 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 PIP5K1BO14986 540 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 PEX10O60683 326 aa16.33■□□□□ 0.2
CTDSP2-201ENST00000398073 GRK3P35626 688 aa16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms