RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375023.3

NOTCH4-201, Transcript of notch 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH4, Length 6,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4-201ENST00000375023 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ARMC5Q96C12 935 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PTPRMP28827 1452 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC28A1O00337 649 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TFECO14948 347 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MGRN1O60291 552 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MAFO75444 373 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CDK7P50613 346 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CLIP4Q8N3C7 705 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MYO19Q96H55 970 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 BTN3A3O00478 584 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MAGEC1O60732 1142 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CYP1A2P05177 515 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 FOSL2P15408 326 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 OAZ1P54368 228 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM35AQ86V20 835 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 IL12RB2Q99665 862 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PHF11Q9UIL8 331 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 NR4A1P22736 598 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CBFBQ13951 182 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 GPER1Q99527 375 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TMCC2O75069 709 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC6A2P23975 617 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SP2Q02086 613 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 FPGSQ05932 587 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 RIN1Q13671 783 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF460Q14592 562 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 KCNK4Q9NYG8 393 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TREHO43280 583 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MLYCDO95822 493 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 STATHP02808 62 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PRKAA2P54646 552 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 C7orf57Q8NEG2 295 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 AGAP11Q8TF27 550 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 VAT1Q99536 393 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PEX14O75381 377 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PDE9AO76083 593 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ALPPL2P10696 532 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF132P52740 706 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ITGA1P56199 1179 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 INHBEP58166 350 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ITGA7Q13683 1181 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 NR1D2Q14995 579 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MZT2AQ6P582 158 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PACS2Q86VP3 889 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 OR4K2Q8NGD2 314 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 DNASE1L2Q92874 299 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 C5orf34Q96MH7 638 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 GNRH1P01148 92 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MYBL2P10244 700 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 RYKP34925 604 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CLCN5P51795 746 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 PPM1JQ5JR12 505 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 DLK2Q6UY11 383 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 CNPY4Q8N129 248 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 STARD8Q92502 1023 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 UROC1Q96N76 676 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 COMMD9Q9P000 198 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms