RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MOSPD1Q9UJG1 213 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PLAGL1Q9UM63 463 aa2.54□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NUP155O75694 1391 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCNB3Q8WWL7 1395 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NLRC5Q86WI3 1866 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV34A0A0B4J273 112 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C16orf96A6NNT2 1141 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MYO1GB0I1T2 1018 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RIPK2O43353 540 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TACC1O75410 805 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GGPS1O95749 300 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ADAP00813 363 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 VIPP01282 170 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CXCL10P02778 98 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IL2RBP14784 551 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FRKP42685 505 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PDK1Q15118 436 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC24Q50LG9 513 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 AKIRIN2Q53H80 203 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF789Q5FWF6 425 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 STRIP1Q5VSL9 837 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GJB7Q6PEY0 223 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PTCHD4Q6ZW05 846 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CATSPER3Q86XQ3 398 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM185AQ8N0U4 392 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OR2T34Q8NGX1 318 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OVCA2Q8WZ82 227 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 POMGNT1Q8WZA1 660 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TOP1MTQ969P6 601 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HAUS1Q96CS2 278 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TSG101Q99816 390 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MYOCQ99972 504 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM83CQ9BQN1 747 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEE1Q9HCI5 957 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TMOD3Q9NYL9 352 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HMG20BQ9P0W2 317 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OSGIN2Q9Y236 505 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KANK1Q14678 1352 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KIF15Q9NS87 1388 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C5orf51A6NDU8 294 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TCAF2A6NFQ2 919 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OOEPA6NGQ2 149 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGA8TH3BQL2 631 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RAB27BO00194 218 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 O00370 1275 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LCE2BO14633 110 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC25A17O43808 307 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC16A8O95907 504 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FTCDO95954 541 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 INHBAP08476 426 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HSPA1LP34931 641 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NKX3-2P78367 333 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CRYMQ14894 314 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OASLQ15646 514 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PTCHD3Q3KNS1 767 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C6orf163Q5TEZ5 329 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C16orf89Q6UX73 402 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 L3MBTL4Q8NA19 623 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KCNE4Q8WWG9 221 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C3orf49Q96BT1 292 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TSNARE1Q96NA8 513 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GBP5Q96PP8 586 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ALS2CR12Q96Q35 445 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ERP44Q9BS26 406 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ARL8BQ9NVJ2 186 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KCNK7Q9Y2U2 307 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 VWA7Q9Y334 891 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SIT1Q9Y3P8 196 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SNX11Q9Y5W9 270 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KIF28PB7ZC32 967 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 L7N2F9 121 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MEIS2O14770 477 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TEX33O43247 280 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PEX11AO75192 247 aa2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NME6O75414 186 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TNFRSF1AP19438 455 aa2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms