RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 ACTL9Q8TC94 416 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 HTR3CQ8WXA8 447 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 SCAMP4Q969E2 229 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 VAT1Q99536 393 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 CYP4F12Q9HCS2 524 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 MOSPD1Q9UJG1 213 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 DOLKQ9UPQ8 538 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 ADGRG1Q9Y653 693 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 PRSS38A1L453 326 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM8BA6NDV4 472 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 H7C0C1 242 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 PMPCBO75439 489 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 FTCDO95954 541 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 SOD1P00441 154 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 GP1BAP07359 652 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 JUPP14923 745 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 ATP5OP48047 213 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 ST3GAL2Q16842 350 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 LVRNQ6Q4G3 990 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 PID1Q7Z2X4 250 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 GKN2Q86XP6 184 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC35F3Q8IY50 421 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 GLMNQ92990 594 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 URB1O60287 2271 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 CPED1A4D0V7 1026 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 NDST3O95803 873 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 CEACAM5P06731 702 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 PYGLP06737 847 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 RBL1P28749 1068 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 SPINT3P49223 89 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 CAMK2BQ13554 666 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 NR0B2Q15466 257 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 GUSBP11Q6P575 273 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 KDELC1Q6UW63 502 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 UBL4BQ8N7F7 174 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 IFI44Q8TCB0 444 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 CCHCR1Q8TD31 782 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 FCRL5Q96RD9 977 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 WDR24Q96S15 920 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 AGAP2Q99490 1192 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM168Q9H0V1 697 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 C10orf88Q9H8K7 445 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 UBP1Q9NZI7 540 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 PKD2L2Q9NZM6 624 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM153AQ9UHL3 310 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 FREM2Q5SZK8 3169 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 ARHGAP6O43182 974 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 TJP3O95049 919 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 FUCA1P04066 466 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 PIRTP0C851 137 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 RPIAP49247 311 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC112Q8NEF3 446 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 EID2BQ96D98 161 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 TSGA10Q9BZW7 698 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 MAGEE1Q9HCI5 957 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 TRHDEQ9UKU6 1024 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 GPR34Q9UPC5 381 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 SHOC2Q9UQ13 582 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF711Q9Y462 761 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP5-201ENST00000366391 RGSL1A5PLK6 1076 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 TRABD2BA6NFA1 517 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 F5H423 210 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 OPA1O60313 960 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 RBP3P10745 1247 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 POLD2P49005 469 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 WNT3AP56704 352 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC70Q6NSX1 233 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 TAF8Q7Z7C8 310 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 HES6Q96HZ4 224 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP5-201ENST00000366391 HIC2Q96JB3 615 aa18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms