RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP2A1O14983 1001 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 INSIG1O15503 277 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HS6ST1O60243 411 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 JRKO75564 520 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE7O76087 117 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2C1O95371 312 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NTN1O95631 604 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NGFRP08138 427 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE12FP0CL80 117 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE12GP0CL81 117 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE12IP0CL82 117 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNHG28P0DPA3 235 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACTN1P12814 892 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GABRB1P18505 474 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 BDNFP23560 247 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 RRM1P23921 792 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSTR2P30874 369 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBA7P41226 1012 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRCPP42785 496 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PEX5P50542 639 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAS2R40P59535 323 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ECT2LQ008S8 904 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 BNC1Q01954 994 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXM1Q08050 763 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDR1Q08345 913 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE1Q13065 139 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAGE4Q13068 117 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACVR2BQ13705 512 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CALCRLQ16602 461 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCGF3Q3KNV8 242 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUSP28Q4G0W2 176 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 XKR9Q5GH70 373 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FRG2Q64ET8 278 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 JADE1Q6IE81 842 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR73Q6P4I2 378 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 DLK2Q6UY11 383 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXRED2Q8IWF2 684 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 HACE1Q8IYU2 909 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 IQCF1Q8N6M8 205 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 RND1Q92730 232 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CALML4Q96GE6 196 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC34Q96HJ3 373 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF479Q96JC4 524 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR1F2PQ96R84 312 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC68Q9H2F9 335 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNN2Q9H2S1 579 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR26Q9H7D7 661 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMP25Q9NPA2 562 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 LTB4R2Q9NPC1 389 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SETD4Q9NVD3 440 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 OCIAD1Q9NX40 245 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SWAP70Q9UH65 585 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 TINAGQ9UJW2 476 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX9Q9Y5X1 595 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLIC4Q9Y696 253 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 KANSL1LA0AUZ9 987 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDRT15L2A8MXV6 281 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 B4DLN1 442 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 K7ENM7 598 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 OGG1O15527 345 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPC4O75487 556 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 DAB1O75553 588 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TPPPO94811 219 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 LDHCP07864 332 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSH1P0DML2 217 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSH2P0DML3 217 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 T-ENOLP0DO92 83 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 FCGR1AP12314 374 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 BDKRB2P30411 391 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLCNKAP51800 687 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAS2R38P59533 333 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-78P-201ENST00000362897 LTBQ06643 244 aa2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms