RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358543.8

ALKAL1-201, Transcript of ALK and LTK ligand 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALKAL1, Length 1,217 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1-201ENST00000358543 SCAMP4Q969E2 229 aa24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1-201ENST00000358543 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1-201ENST00000358543 FSCN3Q9NQT6 498 aa24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1-201ENST00000358543 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1-201ENST00000358543 PKP3Q9Y446 797 aa24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1-201ENST00000358543 MRFAP1Q9Y605 127 aa24.21■■□□□ 1.47
ALKAL1-201ENST00000358543 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 K7ESM1 405 aa24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 DFNA5O60443 496 aa24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 BPIP17213 487 aa24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 TPH1P17752 444 aa24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ADCY8P40145 1251 aa24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 SARNPP82979 210 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ZNF423Q2M1K9 1284 aa24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 LRRC8BQ6P9F7 803 aa24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 PELI3Q8N2H9 469 aa24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 GPR26Q8NDV2 337 aa24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 MCUQ8NE86 351 aa24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 TEX101Q9BY14 249 aa24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ARL5AQ9Y689 179 aa24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 LDB2O43679 373 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 CER1O95813 267 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 SOD1P00441 154 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 SLC4A1P02730 911 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 GPR1P46091 355 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 THOP1P52888 689 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 HLA-BQ31612 363 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 RAET1GQ6H3X3 334 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 PCGF5Q86SE9 256 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 OXR1Q8N573 874 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 WDR26Q9H7D7 661 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 BPIFA1Q9NP55 256 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ASIC3Q9UHC3 531 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 OR1A2Q9Y585 309 aa24.19■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 STX7O15400 261 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 TTI1O43156 1089 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 IVDP26440 423 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 HTR1BP28222 390 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 KIAA1024LP59773 190 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 C2orf54Q08AI8 447 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 LAMB3Q13751 1172 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 NFATC4Q14934 902 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 PDPK2PQ6A1A2 396 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 KDM7AQ6ZMT4 941 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 PPIL6Q8IXY8 311 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 TRAM1L1Q8N609 369 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 RANBP9Q96S59 729 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 AGAP2Q99490 1192 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 EDEM2Q9BV94 578 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 GAREM1Q9H706 876 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 RXFP3Q9NSD7 469 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa24.18■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 FAM187AA6NFU0 413 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 MROH6A6NGR9 719 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 PSMA3P25788 255 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 SPAM1P38567 509 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 RXRGP48443 463 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 NPY2RP49146 381 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 FZD2Q14332 565 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 POU6F1Q14863 301 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 TPRG1LQ5T0D9 272 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ANKRD22Q5VYY1 191 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 MACC1Q6ZN28 852 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ZNF534Q76KX8 674 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 MINDY1Q8N5J2 469 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 NAT8LQ8N9F0 302 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 IL26Q9NPH9 171 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 TMEM9BQ9NQ34 198 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 RIMKLBQ9ULI2 386 aa24.17■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ZNF883P0CG24 379 aa24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 MLNP12872 115 aa24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 KELP23276 732 aa24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 ADRA1DP25100 572 aa24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 HADHAP40939 763 aa24.16■■□□□ 1.46
ALKAL1-201ENST00000358543 LIMK1P53667 647 aa24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms