RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 UBE2QL1A1L167 161 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 PPEF2O14830 753 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 RAMP2O60895 175 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 TAZQ16635 292 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 TCEAL5Q5H9L2 206 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 MBLAC2Q68D91 279 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 CHPFQ8IZ52 775 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP12.31□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 KCNN1Q92952 543 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 MIPEPQ99797 713 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM79Q9BSE2 394 aa12.31□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 LTBP4Q8N2S1 1624 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 SLX4Q8IY92 1834 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 SLC22A2O15244 555 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 ADCY6O43306 1168 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 HSMCR30P0CW71 290 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 CMPK2Q5EBM0 449 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 DSELQ8IZU8 1212 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 CNTD1Q8N815 330 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 IRGQQ8WZA9 623 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 TEKT5Q96M29 485 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 LPIN3Q9BQK8 851 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 TRMOQ9BU70 441 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 CMTM6Q9NX76 183 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 FBXW11Q9UKB1 542 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 KAT6AQ92794 2004 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 SMCO3A2RU48 225 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 HS6ST1O60243 411 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 GNAZP19086 355 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 MAP2K5Q13163 448 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 CCNIQ14094 377 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 ZSWIM7Q19AV6 140 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 TBCELQ5QJ74 424 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 C11orf74Q86VG3 221 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 TREML1Q86YW5 311 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 PGAM4Q8N0Y7 254 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 HAVCR1Q96D42 359 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 ATP13A1Q9HD20 1204 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 TXNRD2Q9NNW7 524 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 GDAP2Q9NXN4 497 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 LRIG2O94898 1065 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 FAM163BP0C2L3 166 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 KELP23276 732 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 CCNCP24863 283 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 FASP25445 335 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 NOS3P29474 1203 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 HTR7P34969 479 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 HCAR3P49019 387 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 NFYCQ13952 458 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 KLHL35Q6PF15 583 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 MARK4Q96L34 752 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 MOCS1Q9NZB8 636 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 CNTN3Q9P232 1028 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 SLC17A6Q9P2U8 582 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 BTBD3Q9Y2F9 522 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 NDUFAF1Q9Y375 327 aa12.3□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 CYP7B1O75881 506 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 NUDT14O95848 222 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 SMPD1P17405 629 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 RAB2AP61019 212 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 LIN52Q52LA3 116 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 MIER2Q8N344 545 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 MID1IP1Q9NPA3 183 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 SPAG4Q9NPE6 437 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 ANAPC2Q9UJX6 822 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 GIT1Q9Y2X7 761 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 V9GYQ6 96 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 VPS4BO75351 444 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 SCGNO76038 276 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 S100GP29377 79 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 LRPAP1P30533 357 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 SOX11P35716 441 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 SCNN1BP51168 640 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 NME5P56597 212 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 BEX3Q00994 111 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 FAM182AQ5T1J6 154 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 NEK5Q6P3R8 708 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 KCTD13Q8WZ19 329 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 RIPOR3Q96MK2 946 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 AGAP2Q99490 1192 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 MNTQ99583 582 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 DAPK2Q9UIK4 370 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PTPRG-201ENST00000295874 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms