RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291901.12

TNNT1-201, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 967 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-201ENST00000291901 ACTR1BP42025 376 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 CDH6P55285 790 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 ACTR1AP61163 376 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 KRT81Q14533 505 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 LRRC66Q68CR7 880 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 USP45Q70EL2 814 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 LRRN4Q8WUT4 740 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 PIH1D2Q8WWB5 315 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 SCAMP4Q969E2 229 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 PMEPA1Q969W9 287 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 CCDC74BQ96LY2 380 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 SEMA3CQ99985 751 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 BPIFA3Q9BQP9 254 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 ABCG8Q9H221 673 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 KCTD5Q9NXV2 234 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 ANAPC7Q9UJX3 599 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa16.7■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 PSMD11O00231 422 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 SOD1P00441 154 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 SERPINC1P01008 464 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 CD48P09326 243 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 FAM87AP0C7U9 286 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 SERPINB6P35237 376 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 GJC1P36383 396 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF165P49910 485 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 NFKB2Q00653 900 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 PTSQ03393 145 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 TMEM164Q5U3C3 297 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF438Q7Z4V0 828 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 AP2M1Q96CW1 435 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 AGAP2Q99490 1192 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 NUP85Q9BW27 656 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 TTLL3Q9Y4R7 772 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa16.69■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 INPP4BO15327 924 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 MFSD11O43934 449 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 IVLP07476 585 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 IL4RP24394 825 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 EPHB1P54762 984 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 DSC2Q02487 901 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 IHHQ14623 411 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 NR1I3Q14994 352 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 NFKBIBQ15653 356 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 RALGPS1Q5JS13 557 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 HGSNATQ68CP4 663 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 DTX1Q86Y01 620 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 CPLX3Q8WVH0 158 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 TEKT4Q8WW24 435 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 OR2M4Q96R27 311 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 TRIM4Q9C037 500 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 FAM117AQ9C073 453 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 ZMYND15Q9H091 742 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 CDH19Q9H159 772 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 TMEM9Q9P0T7 183 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 IP6K2Q9UHH9 426 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 CHKBQ9Y259 395 aa16.68■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 ZW10O43264 779 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 CSF2RBP32927 897 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 LIMK2P53671 638 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 DPTQ07507 201 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 NR1D2Q14995 579 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 CCDC122Q5T0U0 273 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 CPNE8Q86YQ8 564 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 NDUFAF2Q8N183 169 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 TEX26Q8N6G2 289 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 NIPA2Q8N8Q9 360 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 KCNK4Q9NYG8 393 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 PPIL1Q9Y3C6 166 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 PRKAB1Q9Y478 270 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 MYO18BQ8IUG5 2567 aa16.67■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 A0A087X0T9 212 aa16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 A0A0J9YYE9 177 aa16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 FZD6O60353 706 aa16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 ASMTLO95671 621 aa16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 TRBC1P01850 177 aa16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 ITGB2P05107 769 aa16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 FAM228BP0C875 321 aa16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 TEAD1P28347 426 aa16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 GPR3P46089 330 aa16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 ARSDP51689 593 aa16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 TBR1Q16650 682 aa16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 PYCR3Q53H96 274 aa16.66■□□□□ 0.26
TNNT1-201ENST00000291901 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms