RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SNX12Q9UMY4 172 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 USP12O75317 370 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 FGF1P05230 155 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 GRK6P43250 576 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 CDK3Q00526 305 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PRPSAP1Q14558 356 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 RAET1GQ6H3X3 334 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PHACTR4Q8IZ21 702 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 OR1E3Q8WZA6 343 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 WDR92Q96MX6 357 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 FGF22Q9HCT0 170 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 FADS2P1A8MWK0 482 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 TRIM38O00635 465 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 ZNF185O15231 689 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 CEACAM5P06731 702 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 BPIP17213 487 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 HMGCLP35914 325 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 GPR1P46091 355 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 HK3P52790 923 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 SRP54P61011 504 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PPARDQ03181 441 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 GLRX5Q86SX6 157 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 EID2Q8N6I1 236 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 COX14Q96I36 57 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 GPR63Q9BZJ6 419 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 CLPBQ9H078 707 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 TRABDQ9H4I3 376 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 TOR4AQ9NXH8 423 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 DGKBQ9Y6T7 804 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF10CO14798 259 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 IFNB1P01574 187 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 HTR1BP28222 390 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 OR56A4Q8NGH8 313 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PDXPQ96GD0 296 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 TBATAQ96M53 351 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 TBL1YQ9BQ87 522 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 LRRC61Q9BV99 259 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 ETNK1Q9HBU6 452 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 IL17CQ9P0M4 197 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 CES2O00748 559 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 SCAMP1O15126 338 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 RPL22P35268 128 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 DCDC1P59894 354 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 GNG11P61952 73 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 C1orf61Q13536 156 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 TTC27Q6P3X3 843 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 HID1Q8IV36 788 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 AP1M1Q9BXS5 423 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 BPIFA1Q9NP55 256 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 HACD3Q9P035 362 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 KLQ9UEF7 1012 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 BPTFQ12830 3046 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 AQP9O43315 295 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 AP2A1O95782 977 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 POLD2P49005 469 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PTPRCAPQ14761 206 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 CYP1B1Q16678 543 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 PRRT3Q5FWE3 981 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 SLCO6A1Q86UG4 719 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 OR4C6Q8NH72 309 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 LMX1AQ8TE12 382 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-201ENST00000236273 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms