RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 Q6ZVL8 140 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 USP30Q70CQ3 517 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 OR4L1Q8NH43 312 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 EBF1Q9UH73 591 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 FZD4Q9ULV1 537 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 PSAT1Q9Y617 370 aa22.93■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 TLDC2A0PJX2 215 aa22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 PRR23AA6NEV1 266 aa22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 AGPSO00116 658 aa22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 PI15O43692 258 aa22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 FAM155BO75949 473 aa22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 PCDH8O95206 1070 aa22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 CTBP1Q13363 440 aa22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 ZNF470Q6ECI4 717 aa22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 KBTBD6Q86V97 674 aa22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 LRRC6Q86X45 466 aa22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 IL26Q9NPH9 171 aa22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 CATSPERZQ9NTU4 200 aa22.92■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 PSMD11O00231 422 aa22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 TSPAN6O43657 245 aa22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 IVLP07476 585 aa22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 FOXN2P32314 431 aa22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 SLC1A2P43004 574 aa22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 SEMA3AQ14563 771 aa22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 KRT71Q3SY84 523 aa22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 COQ10AQ96MF6 247 aa22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 C19orf43Q9BQ61 176 aa22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.91■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 RASGRF2O14827 1237 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 PRAMEF1O95521 474 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 CNTN4Q8IWV2 1026 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 SCAMP4Q969E2 229 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 TPSD1Q9BZJ3 242 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 ITM2CQ9NQX7 267 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 TMEM221A6NGB7 291 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 M0R296 226 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 TCEA3O75764 348 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 SRP72O76094 671 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 ACSL1P33121 698 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 MSH2P43246 934 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 PXNP49023 591 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 MPP1Q00013 466 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 CHRNA6Q15825 494 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 SEL1L3Q68CR1 1132 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 CALML6Q8TD86 181 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 DTD2Q96FN9 168 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 TBK1Q9UHD2 729 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 APPL1Q9UKG1 709 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.9■■□□□ 1.26
USF2-201ENST00000222305 IGLON5A6NGN9 336 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 WNT9AO14904 365 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 ATP8B1O43520 1251 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 INHBAP08476 426 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 CA5AP35218 305 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 NAB1Q13506 487 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 STRA8Q7Z7C7 330 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 CILP2Q8IUL8 1156 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 ABCG8Q9H221 673 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 FETUBQ9UGM5 382 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 SLC24A2Q9UI40 661 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 CYP8B1Q9UNU6 501 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.89■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa22.88■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa22.88■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa22.88■■□□□ 1.25
USF2-201ENST00000222305 TBC1D3EA0A087X179 549 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms