RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216484.6

SPTLC2-201, Transcript of serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTLC2, Length 8,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2-201ENST00000216484 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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SPTLC2-201ENST00000216484 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.077e-7■■■■■ 37.2
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SPTLC2-201ENST00000216484 DLG4P78352 724 aa14.57□□□□□ -0.08
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.57□□□□□ -0.08
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SPTLC2-201ENST00000216484 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.57□□□□□ -0.08
SPTLC2-201ENST00000216484 OR52J3Q8NH60 311 aa14.57□□□□□ -0.08
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