RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 NUS1Q96E22 293 aa22.05■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 SIRPGQ9P1W8 387 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 GULP1Q9UBP9 304 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.05■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 MYO1FO00160 1098 aa22.04■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 PSMD11O00231 422 aa22.04■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 SUV39H1O43463 412 aa22.04■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 LHCGRP22888 699 aa22.04■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.04■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 PPIL1Q9Y3C6 166 aa22.04■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 CD48P09326 243 aa22.03■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 HGFP14210 728 aa22.03■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 KRT81Q14533 505 aa22.03■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 TCEA2Q15560 299 aa22.03■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 MANEAQ5SRI9 462 aa22.03■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.03■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 TMEM159Q96B96 161 aa22.03■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 PISDQ9UG56 409 aa22.03■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa22.03■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 A0A1W2PQM1 296 aa22.02■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 PRSS38A1L453 326 aa22.02■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 A8MX80 341 aa22.02■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 CCDC122Q5T0U0 273 aa22.02■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.02■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.02■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 SCRN2Q96FV2 425 aa22.02■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 ZNF670Q9BS34 389 aa22.02■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 TEX101Q9BY14 249 aa22.02■■□□□ 1.12
SRRT-218ENST00000620394 BSNQ9UPA5 3926 aa22.02■■□□□ 1.12
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SRRT-218ENST00000620394 FZD6O60353 706 aa22.01■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 PPFIA2O75334 1257 aa22.01■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 CASP14P31944 242 aa22.01■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 CCL7P80098 99 aa22.01■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa22.01■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.01■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 FAF2Q96CS3 445 aa22.01■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 LRRN3Q9H3W5 708 aa22.01■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 PNLIPP16233 465 aa22■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 GLB1P16278 677 aa22■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 NFKBIBQ15653 356 aa22■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 COLEC12Q5KU26 742 aa22■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 USP45Q70EL2 814 aa22■■□□□ 1.11
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