RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	LDAH	Q9H6V9	325 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM206	Q9H813	350 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	COX11	Q9Y6N1	276 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	STK36	Q9NRP7	1315 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	HEATR9	A2RTY3	570 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	KLHL33	A6NCF5	533 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	UNC119B	A6NIH7	251 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ALG1L2	C9J202	215 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PRRT4	C9JH25	899 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	KCNAB3	O43448	404 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SEMA4F	O95754	770 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	GPANK1	O95872	356 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SLC6A2	P23975	617 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	HSPA4	P34932	840 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	UGT1A5	P35504	534 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PDX1	P52945	283 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	BCAT1	P54687	386 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	KCNB1	Q14721	858 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	STARD3	Q14849	445 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	EMC2	Q15006	297 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768		Q8NA96	180 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CAVIN3	Q969G5	261 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	NACC2	Q96BF6	587 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	CEP170P1	Q96L14	293 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	MYOC	Q99972	504 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM9	Q9C026	710 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	MKS1	Q9NXB0	559 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	GCNT4	Q9P109	453 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	DEC1	Q9P2X7	70 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PISD	Q9UG56	409 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	INTU	Q9ULD6	942 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MLH1-223	ENST00000616768	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		5.09	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	MYH10	P35580	1976 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	OR6C75	A6NL08	312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	HIP1	O00291	1037 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	DUX1	O43812	170 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PRAMEF10	O60809	474 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CNTN5	O94779	1100 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	HAUS5	O94927	633 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PRSS23	O95084	383 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	NUDT3	O95989	172 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	IGLV3-19	P01714	112 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	IGHV4-34	P06331	123 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ITGAM	P11215	1152 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CKMT1A	P12532	417 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ITIH1	P19827	911 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CD38	P28907	300 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	JAK3	P52333	1124 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	VAV2	P52735	878 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	COPA	P53621	1224 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	NXPH1	P58417	271 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	GAD2	Q05329	585 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TFDP1	Q14186	410 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	RAB39A	Q14964	217 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM198	Q66K66	360 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	USP37	Q86T82	979 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SLC25A45	Q8N413	288 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		5.08	□□□□□ -1.6

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