RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 ASS1P00966 412 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CAPN3P20807 821 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 UBA7P41226 1012 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TBX4P57082 545 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 BIRC3Q13489 604 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 RD3Q7Z3Z2 195 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 KDELC2Q7Z4H8 507 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SPATA21Q7Z572 469 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 FAM129CQ86XR2 697 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 NRSN1Q8IZ57 195 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 FAM81AQ8TBF8 368 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PARD3BQ8TEW8 1205 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SLC39A13Q96H72 371 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R16AQ96I34 528 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CTRCQ99895 268 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ZPBPQ9BS86 351 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 NOD2Q9HC29 1040 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TMEM9Q9P0T7 183 aa11.74□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GVL5 298 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 FAM221AA4D161 298 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TGFB1I1O43294 461 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 DPM1O60762 260 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CTSEP14091 401 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 IDEP14735 1019 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PFKFB1P16118 471 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 BMP6P22004 513 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 DLSTP36957 453 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ABL2P42684 1182 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SYKP43405 635 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 MC2RQ01718 297 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SGCGQ13326 291 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SQSTM1Q13501 440 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CRB2Q5IJ48 1285 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CEACAM20Q6UY09 585 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 LGI2Q8N0V4 545 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SCML4Q8N228 414 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 GLIS1Q8NBF1 620 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PDXPQ96GD0 296 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 APMAPQ9HDC9 416 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.73□□□□□ -0.53
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HCG18-241ENST00000602290 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PDP2Q9P2J9 529 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ITM2BQ9Y287 266 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa11.73□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 A6NCN8 305 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 B4DGG1 531 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 LEFTY1O75610 366 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 MT-CO1P00395 513 aa11.72□□□□□ -0.53
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HCG18-241ENST00000602290 SCTRP47872 440 aa11.72□□□□□ -0.53
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HCG18-241ENST00000602290 ADIGQ0VDE8 80 aa11.72□□□□□ -0.53
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HCG18-241ENST00000602290 SLC39A14Q15043 492 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CHRNA6Q15825 494 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ARSIQ5FYB1 569 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 HPS6Q86YV9 775 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 IQCKQ8N0W5 287 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 ATL2Q8NHH9 583 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 NSMCE1Q8WV22 266 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TAF4BQ92750 862 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 HDAC11Q96DB2 347 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 DESI2Q9BSY9 194 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CENPHQ9H3R5 247 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 COPG2Q9UBF2 871 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 IL36AQ9UHA7 158 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 DGKBQ9Y6T7 804 aa11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 GMNCA6NCL1 334 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TCAF2A6NFQ2 919 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 K7ERQ8 282 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 E2F3O00716 465 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 INPP4BO15327 924 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TSPAN6O43657 245 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 CREG1O75629 220 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 WFS1O76024 890 aa11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HCG18-241ENST00000602290 TACR2P21452 398 aa11.71□□□□□ -0.53
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