RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 CDK3Q00526 305 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 SPIDRQ14159 915 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 ODF2Q5BJF6 829 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 KCTD16Q68DU8 428 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 RAET1GQ6H3X3 334 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 CRTC1Q6UUV9 634 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 NYAP1Q6ZVC0 841 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 ZNF765Q7L2R6 523 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 TSPAN33Q86UF1 283 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 PDZD3Q86UT5 571 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 RHOT1Q8IXI2 618 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 PLD5Q8N7P1 536 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 FAM46DQ8NEK8 389 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 BRD8Q9H0E9 1235 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 TMEM168Q9H0V1 697 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 SIRPGQ9P1W8 387 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 MOSPD1Q9UJG1 213 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 TTLL3Q9Y4R7 772 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 LAMA5O15230 3695 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 CAPN8A6NHC0 703 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 APOL1O14791 398 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 MPOP05164 745 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 CEACAM5P06731 702 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 PNLIPP16233 465 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 GLB1P16278 677 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 PTSQ03393 145 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 PEX6Q13608 980 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 PDK1Q15118 436 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 LRRC66Q68CR7 880 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 NRSN1Q8IZ57 195 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 GPBAR1Q8TDU6 330 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 CCDC74AQ96AQ1 378 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 AP2M1Q96CW1 435 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 LYSMD1Q96S90 227 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 GSDMCQ9BYG8 508 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 TRIM5Q9C035 493 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 PCDH9Q9HC56 1237 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 APPL1Q9UKG1 709 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 CHKBQ9Y259 395 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 PRLP01236 227 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 JCHAINP01591 159 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 GPR1P46091 355 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 STC1P52823 247 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 HADHBP55084 474 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 NIPAL4Q0D2K0 466 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 IHHQ14623 411 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 TCEA2Q15560 299 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 KIAA1524Q8TCG1 905 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 LGMNQ99538 433 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 ABCG8Q9H221 673 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 THSD1Q9NS62 852 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 HEY1Q9Y5J3 304 aa17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 GOLGA6CA6NDK9 693 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 GOLGA6BA6NDN3 693 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 KCNK1O00180 336 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 NOBOXO60393 691 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 KRT1P04264 644 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 IVLP07476 585 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 GOLGA6DP0CG33 693 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 MAGEA1P43355 309 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 PTPRRQ15256 657 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 C14orf28Q4W4Y0 310 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 CERCAMQ5T4B2 595 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 ZNF248Q8NDW4 579 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 ADGRE3Q9BY15 652 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 DPEP2Q9H4A9 486 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa17.96■□□□□ 0.47
CTIF-209ENST00000591387 CCDC187A0A096LP49 1063 aa17.95■□□□□ 0.46
CTIF-209ENST00000591387 RGSL1A5PLK6 1076 aa17.95■□□□□ 0.46
CTIF-209ENST00000591387 ANKRD66B4E2M5 251 aa17.95■□□□□ 0.46
CTIF-209ENST00000591387 SPOPO43791 374 aa17.95■□□□□ 0.46
CTIF-209ENST00000591387 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CTIF-209ENST00000591387 LCA5LO95447 670 aa17.95■□□□□ 0.46
CTIF-209ENST00000591387 COMTP21964 271 aa17.95■□□□□ 0.46
CTIF-209ENST00000591387 NR2C2P49116 596 aa17.95■□□□□ 0.46
CTIF-209ENST00000591387 AP1B1Q10567 949 aa17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms