RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579527.5

TSPOAP1-AS1-203, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,042 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ERVK-6Q9BXR3 956 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CATSPERZQ9NTU4 200 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 HACD3Q9P035 362 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SARDHQ9UL12 918 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 COCHO43405 550 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ATP4BP51164 291 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MS4A2Q01362 244 aa25.61■■□□□ 1.69
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ZNF549Q6P9A3 640 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PIM3Q86V86 326 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DENND1CQ8IV53 801 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa25.61■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LRGUKQ96M69 825 aa25.61■■□□□ 1.69
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PSME3P61289 254 aa25.6■■□□□ 1.69
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ADGRE1Q14246 886 aa25.6■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SEMA3AQ14563 771 aa25.6■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 MMEL1Q495T6 779 aa25.6■■□□□ 1.69
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ACTL7AQ9Y615 435 aa25.6■■□□□ 1.69
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RHEBL1Q8TAI7 183 aa25.59■■□□□ 1.69
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ILVBLA1L0T0 632 aa25.59■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KIF3CO14782 793 aa25.59■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SLC4A1P02730 911 aa25.59■■□□□ 1.69
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 EPS15L1Q9UBC2 864 aa25.59■■□□□ 1.69
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 GBF1Q92538 1859 aa25.59■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 INSIG1O15503 277 aa25.58■■□□□ 1.69
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 STC1P52823 247 aa25.58■■□□□ 1.69
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TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CLYBLQ8N0X4 340 aa25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ADCY4Q8NFM4 1077 aa25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SH3RF2Q8TEC5 729 aa25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SCLYQ96I15 445 aa25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SLC25A23Q9BV35 468 aa25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 VN1R3Q9BXE9 311 aa25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CWH43Q9H720 699 aa25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RIMS3Q9UJD0 308 aa25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 KLKB1P03952 638 aa25.58■■□□□ 1.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 RGRP47804 291 aa25.58■■□□□ 1.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PPP1R3AQ16821 1122 aa25.58■■□□□ 1.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 REP15Q6BDI9 236 aa25.58■■□□□ 1.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 PHC3Q8NDX5 983 aa25.58■■□□□ 1.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TSC22D3Q99576 134 aa25.58■■□□□ 1.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
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