RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 FAPQ12884 760 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 IL17AQ16552 155 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TBCELQ5QJ74 424 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MIEF2Q96C03 454 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 DCLK3Q9C098 648 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 HES2Q9Y543 173 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MICAL3Q7RTP6 2002 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 LACTBL1A8MY62 500 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MEN1O00255 615 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CLDN4O14493 209 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 FCER2P06734 321 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.061e-7■■■■□ 20.2
PDPR-210ENST00000568530 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 GALNT13Q8IUC8 556 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SNX33Q8WV41 574 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CEP295NLQ96MC4 621 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 RNF145Q96MT1 663 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 PANX3Q96QZ0 392 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SEPT3Q9UH03 358 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TPBGLP0DKB5 382 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MMP13P45452 471 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ACSM2AQ08AH3 577 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 PGM5Q15124 567 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ACSM2BQ68CK6 577 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 FAM110BQ8TC76 370 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 FNDC11Q9BVV2 318 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 IFT46Q9NQC8 304 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 KCND2Q9NZV8 630 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 A0A1W2PQ67 120 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MPPED1O15442 326 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TNFRSF21O75509 655 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 TPPPO94811 219 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ITGAVP06756 1048 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 GJB1P08034 283 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 RARAP10276 462 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 PSMD5Q16401 504 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 DKK3Q9UBP4 350 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CKLFQ9UBR5 152 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 DKKL1Q9UK85 242 aa8.45□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 EML1O00423 815 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SGTAO43765 313 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CCNDBP1O95273 360 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 PGAM2P15259 253 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.061e-6■□□□□ 10.1
PDPR-210ENST00000568530 NAMPTP43490 491 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 IRF8Q02556 426 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 FAAP100Q0VG06 881 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SSX6Q7RTT6 188 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SLC2A14Q8TDB8 520 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MR1Q95460 341 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 NDNQ99608 321 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 DGCR6LQ9BY27 220 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 GLOD4Q9HC38 313 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 HCN1O60741 890 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ALOX5P09917 674 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 AVPR1BP47901 424 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 FAM182AQ5T1J6 154 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CHST9Q7L1S5 443 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ZNF527Q8NB42 609 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 IKZF4Q9H2S9 585 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 RAD54BQ9Y620 910 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 OR10H3O60404 316 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 PRH1P02810 166 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 CALB2P22676 271 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 S100A3P33764 101 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 SPIBQ01892 262 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 ZNF844Q08AG5 666 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 RUNX2Q13950 521 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 Q4G0T1 1027 aa8.44□□□□□ -1.06
PDPR-210ENST00000568530 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.44□□□□□ -1.06
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