RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	PNPO	Q9NVS9	261 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	OXSM	Q9NWU1	459 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	MID2	Q9UJV3	735 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ACOT9	Q9Y305	439 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ARL5A	Q9Y689	179 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	OR51F1	A6NGY5	319 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	SOBP	A7XYQ1	873 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	TARM1	B6A8C7	271 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	CBX4	O00257	560 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	GFRA2	O00451	464 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	INSIG1	O15503	277 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM13	O60858	407 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	PFKL	P17858	780 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	GLRB	P48167	497 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	CLCN5	P51795	746 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	ARF5	P84085	180 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	EML3	Q32P44	896 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279		Q6ZNB5	142 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	STYX	Q8WUJ0	223 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	CHFR	Q96EP1	664 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	EXOC2	Q96KP1	924 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	NDN	Q99608	321 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	OLFM1	Q99784	485 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	EBF4	Q9BQW3	602 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TCF4-231	ENST00000566279		A0A087X1B8	175 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ANTXRL	A6NF34	631 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	CAPN14	A8MX76	684 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM114	B3SHH9	223 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF195	O14628	629 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TBL1X	O60907	577 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	KLHL2	O95198	593 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	CD160	O95971	181 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PIRT	P0C851	137 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	SRF	P11831	508 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PRAME	P78395	509 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TUBB3	Q13509	450 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	LAMB3	Q13751	1172 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PTPRCAP	Q14761	206 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	FSCB	Q5H9T9	825 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM25	Q86YD3	366 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PEX13	Q92968	403 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	NXNL1	Q96CM4	212 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	SCYL1	Q96KG9	808 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TBATA	Q96M53	351 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	MUC3B	Q9H195	1237 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	OBP2A	Q9NY56	170 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ARMCX1	Q9P291	453 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	XPR1	Q9UBH6	696 aa		10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	KRBA1	A5PL33	1030 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM24	O15164	1050 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	SNAP91	O60641	907 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ZMPSTE24	O75844	475 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ATP6V1G2	O95670	118 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	S1PR4	O95977	384 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	PRL	P01236	227 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	CYP17A1	P05093	508 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	TCF3	P15923	654 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	SCNN1B	P51168	640 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	MESP2	Q0VG99	397 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-231	ENST00000566279	LIPM	Q5VYY2	423 aa		10.14	□□□□□ -0.79

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