RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	THEG	Q9P2T0	379 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	NOD1	Q9Y239	953 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		18.4	■□□□□ 0.54
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0J9YYE9	177 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SYN3	O14994	580 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SEPT4	O43236	478 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ASGR1	P07306	291 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	GRK4	P32298	578 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	RING1	Q06587	406 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	APOF	Q13790	326 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	IYD	Q6PHW0	289 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MIB1	Q86YT6	1006 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	BBS5	Q8N3I7	341 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	OR2T3	Q8NH03	318 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO32	Q969P5	355 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	C3orf30	Q96M34	536 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	HAUS8	Q9BT25	410 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		18.39	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINF2	P08697	491 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ARSA	P15289	507 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN8	P19075	237 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	GPR15	P49685	360 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	STC1	P52823	247 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	COQ5	Q5HYK3	327 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	KANK2	Q63ZY3	851 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	BORA	Q6PGQ7	559 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	LAYN	Q6UX15	382 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	EXT2	Q93063	718 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	GID8	Q9NWU2	228 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	DMTF1	Q9Y222	760 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ARL5A	Q9Y689	179 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ANGPT2	O15123	496 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ADAMTS4	O75173	837 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	OR6B1	O95007	311 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MATN4	O95460	622 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV3-27	P01718	113 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	GFAP	P14136	432 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ETS2	P15036	469 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CDH13	P55290	713 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	NRF1	Q16656	503 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PFKFB4	Q16877	469 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	NADK2	Q4G0N4	442 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		18.38	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	AQP12B	A6NM10	295 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	KERA	O60938	352 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	NDST3	O95803	873 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MT-CO1	P00395	513 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V1B1	P15313	513 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	LBP	P18428	481 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	OR1G1	P47890	313 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V0D1	P61421	351 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	BNIP2	Q12982	314 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	OR4D1	Q15615	310 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53

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