RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559494.1

TSPAN3-207, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,326 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-207ENST00000559494 GDF3Q9NR23 364 aa20.27■□□□□ 0.83
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TSPAN3-207ENST00000559494 THOP1P52888 689 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPAN3-207ENST00000559494 BNIP3Q12983 259 aa20.22■□□□□ 0.83
TSPAN3-207ENST00000559494 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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TSPAN3-207ENST00000559494 GPR26Q8NDV2 337 aa20.22■□□□□ 0.83
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