RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	IL17F	Q96PD4	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787		J3KRW8	73 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	CHM	P24386	653 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	MCM3	P25205	808 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	EFNA5	P52803	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZBED6	P86452	979 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	TFAP4	Q01664	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	TROAP	Q12815	778 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	LRMP	Q12912	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	FIG4	Q92562	907 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	CSF3R	Q99062	836 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A0G2JPF8	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	SNAP23	O00161	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	BUB3	O43684	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	KDM4B	O94953	1096 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	NFKBIA	P25963	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	HOXC9	P31274	260 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	USP8	P40818	1118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	DCST1	Q5T197	706 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	PDILT	Q8N807	584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	MOAP1	Q96BY2	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	SIL1	Q9H173	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	HS3ST1	O14792	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPINT2	O43291	252 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	NDUFS3	O75489	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CYC1	P08574	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARL3	P36405	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	NLRP5	P59047	1200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	NAB2	Q15742	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PAPOLA-222	ENST00000556787	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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