RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.5□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 CBSP35520 551 aa8.5□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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PTPRB-208ENST00000550358 RAI2Q9Y5P3 530 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRB-208ENST00000550358 CLDN4O14493 209 aa8.49□□□□□ -1.05
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