RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 ZNF284Q2VY69 593 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 INAVAQ3KP66 663 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 CFAP58Q5T655 872 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 HES3Q5TGS1 186 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 NEK5Q6P3R8 708 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 TRIM69Q86WT6 500 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 HORMAD1Q86X24 394 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 KATNAL2Q8IYT4 538 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 BBS5Q8N3I7 341 aa9.69□□□□□ -0.86
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CS-217ENST00000550044 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
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CS-217ENST00000550044 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 HEMGNQ9BXL5 484 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.69□□□□□ -0.86
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CS-217ENST00000550044 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
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CS-217ENST00000550044 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.69□□□□□ -0.86
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CS-217ENST00000550044 A8MX80 341 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 ZNF487B1APH4 448 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 H0Y8X5 98 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 KCNK1O00180 336 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 ENC1O14682 589 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 AREL1O15033 823 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 TSPAN6O43657 245 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 AP1G1O43747 822 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 PCDHGA12O60330 932 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 RFPL3O75679 317 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 FTCDO95954 541 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 JCHAINP01591 159 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 CCNB1P14635 433 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 CR2P20023 1033 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 MX2P20592 715 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 SERPINA4P29622 427 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 GRIA4P48058 902 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 C21orf59P57076 290 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 CLDN2P57739 230 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 RPS21P63220 83 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 RHDQ02161 417 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 DSC2Q02487 901 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 AP1B1Q10567 949 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 DNAJC3Q13217 504 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 SGCGQ13326 291 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 TFDP2Q14188 446 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 FGL2Q14314 439 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 TFDP3Q5H9I0 405 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 ARHGAP40Q5TG30 622 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 AADACL2Q6P093 401 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 NT5DC3Q86UY8 548 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 VSIG1Q86XK7 387 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 TEX26Q8N6G2 289 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 LRRC57Q8N9N7 239 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 EXD1Q8NHP7 514 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 HCAR2Q8TDS4 363 aa9.68□□□□□ -0.86
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CS-217ENST00000550044 HDAC11Q96DB2 347 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
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CS-217ENST00000550044 MGME1Q9BQP7 344 aa9.68□□□□□ -0.86
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CS-217ENST00000550044 CEP41Q9BYV8 373 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 TRIM4Q9C037 500 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 NRSN2Q9GZP1 204 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 CPNE5Q9HCH3 593 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.68□□□□□ -0.86
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CS-217ENST00000550044 AMFRQ9UKV5 643 aa9.68□□□□□ -0.86
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CS-217ENST00000550044 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PR77 199 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.67□□□□□ -0.86
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CS-217ENST00000550044 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 VILLO15195 856 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 RAD51BO15315 384 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-217ENST00000550044 HLA-DQB2P05538 268 aa9.67□□□□□ -0.86
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