RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 DDCP20711 480 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 THPOP40225 353 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 MLH1P40692 756 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 LMAN1P49257 510 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 VCPP55072 806 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 C1QTNF8P60827 252 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 CAV1Q03135 178 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 BST2Q10589 180 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 ITGA7Q13683 1181 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 LPIN1Q14693 890 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 PPP1R7Q15435 360 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 PTGISQ16647 500 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 CA9Q16790 459 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 SMTNL2Q2TAL5 461 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 KCTD16Q68DU8 428 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 LRRC31Q6UY01 552 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 ARCQ7LC44 396 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 ADGRF2Q8IZF7 708 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 KCTD6Q8NC69 237 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 APPL2Q8NEU8 664 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 CD99L2Q8TCZ2 262 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 SLC2A14Q8TDB8 520 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 GRK7Q8WTQ7 553 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 TLCD1Q96CP7 247 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 HAUS1Q96CS2 278 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 SNF8Q96H20 258 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 CAPNS2Q96L46 248 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 CFAP57Q96MR6 1250 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 RNF157Q96PX1 679 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 RUFY1Q96T51 708 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 TMEM109Q9BVC6 243 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 MAGEB5Q9BZ81 275 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 C10orf88Q9H8K7 445 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 ASIC3Q9UHC3 531 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 ANAPC5Q9UJX4 755 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 PADI3Q9ULW8 664 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.59□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 PLXNB2O15031 1838 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 A0A0U1RQF3 1178 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MYBPHLA2RUH7 354 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ARL5CA6NH57 179 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RIPK2O43353 540 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SGTAO43765 313 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CAND2O75155 1236 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CABYRO75952 493 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RNF8O76064 485 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 TOMM70O94826 608 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ABHD16AO95870 558 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 GAS8O95995 478 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ITGB1P05556 798 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 THP07101 528 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RAP2AP10114 183 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 HOXD10P28358 340 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RPL9P32969 192 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 RPL22P35268 128 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ACTN2P35609 894 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 PTPN9P43378 593 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ACADSBP45954 432 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ALDH1A3P47895 512 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 NDUFV1P49821 464 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CLCNKBP51801 687 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ACLYP53396 1101 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 BCAT1P54687 386 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CDH6P55285 790 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 HDAC4P56524 1084 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 FAM189BP81408 668 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 CALCOCO2Q13137 446 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 MTM1Q13496 603 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 DPYSL3Q14195 570 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 SLMAPQ14BN4 828 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 BOLA3Q53S33 107 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 AFMIDQ63HM1 303 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 ANKS6Q68DC2 871 aa5.58□□□□□ -1.52
TRDN-205ENST00000546248 NPNTQ6UXI9 565 aa5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms