RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 UBP1Q9NZI7 540 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 VWA7Q9Y334 891 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 MCM3APO60318 1980 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 FAM149AA5PLN7 773 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TRIM43BA6NCK2 446 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 I6L893 689 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 E2F6O75461 281 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 KCNE1P15382 129 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 JAK1P23458 1154 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 OXTRP30559 389 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 GSK3BP49841 420 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 NEDD8Q15843 81 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CYP51A1Q16850 503 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 XKR4Q5GH76 650 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 PITRM1Q5JRX3 1037 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 HECTD2Q5U5R9 776 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 NOTUMQ6P988 496 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 HFE2Q6ZVN8 426 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 OSTM1Q86WC4 334 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SPATA6LQ8N4H0 392 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ATPAF2Q8N5M1 289 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SLC15A4Q8N697 577 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 IPMKQ8NFU5 416 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CCDC138Q96M89 665 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 PPP1R16BQ96T49 567 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 COLEC11Q9BWP8 271 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ULBP1Q9BZM6 244 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 RAD21L1Q9H4I0 556 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 NANOGQ9H9S0 305 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ARNT2Q9HBZ2 717 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SLC52A3Q9NQ40 469 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 DDIT4Q9NX09 232 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 A0A1W2PP18 115 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TMEM247A6NEH6 219 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ASB14A6NK59 587 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 NRP1O14786 923 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 AZIN1O14977 448 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 MATN3O15232 486 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SPTLC1O15269 473 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 INPP4BO15327 924 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SLC7A4O43246 635 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TULP3O75386 442 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 RECQL4O94761 1208 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SUPT7LO94864 414 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 LRIG2O94898 1065 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 PRSS23O95084 383 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ARSAP15289 507 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 MATN1P21941 496 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 AXLP30530 894 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TMEM62Q0P6H9 643 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SEPT6Q14141 434 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 KCTD2Q14681 263 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 BCL2A1Q16548 175 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 RAB41Q5JT25 222 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CLEC6AQ6EIG7 209 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 GALNT18Q6P9A2 607 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 RANBP10Q6VN20 620 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 PAQR9Q6ZVX9 377 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 NEK10Q6ZWH5 1172 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SAMD7Q7Z3H4 446 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 OFCC1Q8IZS5 231 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SCAIQ8N9R8 606 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 BPIFB1Q8TDL5 484 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 TWIST2Q8WVJ9 160 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 S100ZQ8WXG8 99 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 SNX19Q92543 992 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 C3orf30Q96M34 536 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 GLT1D1Q96MS3 346 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 CXCL16Q9H2A7 254 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 ALG2Q9H553 416 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 POPDC3Q9HBV1 291 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-202ENST00000542324 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms