RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TTC8Q8TAM2 541 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP33Q8TEY7 942 aa5.68□□□□□ -1.5
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NINJ1Q92982 152 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP2A3Q93084 1043 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RTP4Q96DX8 246 aa5.68□□□□□ -1.5
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP29Q9HBJ7 922 aa5.68□□□□□ -1.5
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CBX4O00257 560 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHADO15335 359 aa5.68□□□□□ -1.5
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ADMP35318 185 aa5.68□□□□□ -1.5
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MMP13P45452 471 aa5.68□□□□□ -1.5
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDIK1LQ8N165 341 aa5.68□□□□□ -1.5
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPWQ8N729 165 aa5.68□□□□□ -1.5
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SEC14L1Q92503 715 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ART4Q93070 314 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FATE1Q969F0 183 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WBP2Q969T9 261 aa5.68□□□□□ -1.5
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EXOC2Q96KP1 924 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SH3GL1Q99961 368 aa5.68□□□□□ -1.5
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRPV4Q9HBA0 871 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEU2Q9Y3R4 380 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNX5Q9Y5X3 404 aa5.68□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.67□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa5.67□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNK1O00180 336 aa5.67□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRAMEF11O60813 436 aa5.67□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRAMEF12O95522 483 aa5.67□□□□□ -1.5
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APRTP07741 180 aa5.67□□□□□ -1.5
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