RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 IFT43Q96FT9 208 aa16.88■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 LYSMD1Q96S90 227 aa16.88■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 ADGRE3Q9BY15 652 aa16.88■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.88■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa16.88■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 ESYT3A0FGR9 886 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD66B4E2M5 251 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 AP3B1O00203 1094 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 MID1O15344 667 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 MAP3K13O43283 966 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 RHOXF2BP0C7M4 288 aa16.87■□□□□ 0.29
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PACS1-208ENST00000529677 TNFRSF8P28908 595 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 LMAN1P49257 510 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 NEK3P51956 506 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 CDH17Q12864 832 aa16.87■□□□□ 0.29
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PACS1-208ENST00000529677 SIRPB2Q5JXA9 342 aa16.87■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 ARMC3Q5W041 872 aa16.87■□□□□ 0.29
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PACS1-208ENST00000529677 SIPA1Q96FS4 1042 aa16.87■□□□□ 0.29
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PACS1-208ENST00000529677 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa16.87■□□□□ 0.29
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PACS1-208ENST00000529677 CAPN8A6NHC0 703 aa16.86■□□□□ 0.29
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PACS1-208ENST00000529677 SLC7A4O43246 635 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 SPINT1O43278 529 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 AP1G1O43747 822 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 USP12O75317 370 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 PPFIA2O75334 1257 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 ALDH1A2O94788 518 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 TRBC1P01850 177 aa16.86■□□□□ 0.29
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PACS1-208ENST00000529677 ABL2P42684 1182 aa16.86■□□□□ 0.29
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PACS1-208ENST00000529677 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 SYCP2LQ5T4T6 812 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 AGBL4Q5VU57 503 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 IFT20Q8IY31 132 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 CEP76Q8TAP6 659 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 HMGB4Q8WW32 186 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 UBXN4Q92575 508 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 SCRN2Q96FV2 425 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 SPACA7Q96KW9 195 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 SERPINB12Q96P63 405 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 PHACTR1Q9C0D0 580 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 SLC6A17Q9H1V8 727 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 PRORYQ9H606 182 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 DYRK4Q9NR20 520 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 FZD4Q9ULV1 537 aa16.86■□□□□ 0.29
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PACS1-208ENST00000529677 UNC79Q9P2D8 2635 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 C10orf142B7Z368 130 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 ADRB3P13945 408 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 ECHS1P30084 290 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 MMP12P39900 470 aa16.85■□□□□ 0.29
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PACS1-208ENST00000529677 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 CCDC15Q0P6D6 951 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 SLC14A1Q13336 389 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 CFAP58Q5T655 872 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 OR52K1Q8NGK4 314 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 FBXO25Q8TCJ0 367 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 ERLEC1Q96DZ1 483 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 APOL2Q9BQE5 337 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 MAGEE1Q9HCI5 957 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 CD93Q9NPY3 652 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-208ENST00000529677 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.85■□□□□ 0.29
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