RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526539.2

SLC38A6-209, Transcript of solute carrier family 38 member 6, humanhuman

TSL 4

Gene SLC38A6, Length 755 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A6-209ENST00000526539 DAPK3O43293 454 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 PHF2O75151 1096 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 ERLIN1O75477 346 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 GRAP2O75791 330 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 SEC24AO95486 1093 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 HOXC13P31276 330 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 LSP1P33241 339 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 AVPR1AP37288 418 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 ARSEP51690 589 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 DRG2P55039 364 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 CAV1Q03135 178 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 FOXL1Q12952 345 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 NME3Q13232 169 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 PDK1Q15118 436 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 TAF5Q15542 800 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 SYPL2Q5VXT5 272 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 ARMC3Q5W041 872 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 CES5AQ6NT32 575 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 C8orf74Q6P047 294 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 CLEC14AQ86T13 490 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 TAC4Q86UU9 113 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 CCDC89Q8N998 374 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 VN1R2Q8NFZ6 395 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 ATL2Q8NHH9 583 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 CLEC4CQ8WTT0 213 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 ARNTL2Q8WYA1 636 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 KRT35Q92764 455 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 EDAQ92838 391 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 RNF157Q96PX1 679 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 ADOQ96SZ5 270 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 VAT1Q99536 393 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 CALN1Q9BXU9 219 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 TKTL2Q9H0I9 626 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 TASP1Q9H6P5 420 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 PIGVQ9NUD9 493 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 OBP2AQ9NY56 170 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 AMACRQ9UHK6 382 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 E2F8A0AVK6 867 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 HIDE1A8MVS5 230 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 F5H5T6 163 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 AP3B1O00203 1094 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 MATN3O15232 486 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 CLDN11O75508 207 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 BPIP17213 487 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 HDCP19113 662 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 TNFRSF1AP19438 455 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 GABRR2P28476 465 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 MTHFRP42898 656 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 NDST2P52849 883 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 TAS2R40P59535 323 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 TPI1P60174 286 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 SEMA3BQ13214 749 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 CUL1Q13616 776 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 RIN1Q13671 783 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 CAMK1Q14012 370 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 DPYSL3Q14195 570 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 DHCR24Q15392 516 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 C5orf22Q49AR2 442 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 RFX8Q6ZV50 586 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 CHST9Q7L1S5 443 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 SPRED1Q7Z699 444 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 PCGF5Q86SE9 256 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 C11orf74Q86VG3 221 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 FAM131BQ86XD5 332 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 IFT20Q8IY31 132 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 COG1Q8WTW3 980 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 HSPH1Q92598 858 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 EXOC4Q96A65 974 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 TBC1D31Q96DN5 1066 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 SOX7Q9BT81 388 aa7.29□□□□□ -1.24
SLC38A6-209ENST00000526539 TRIM7Q9C029 511 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms