RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 PARNO95453 639 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRSS56P0CW18 603 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCTP40126 519 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAGE5Q13069 117 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAGE6Q13070 117 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 NAA25Q14CX7 972 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC45A4Q5BKX6 768 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR38Q5JTN6 314 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCTE1Q5JU00 501 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM83BQ5T0W9 1011 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKRD54Q6NXT1 300 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPAT4Q86UL3 456 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM57Q8N5G2 664 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM222BQ8WU58 562 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 AFG1LQ8WV93 481 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 BBS4Q96RK4 519 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 TWNKQ96RR1 684 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 NEURL2Q9BR09 285 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 CRB3Q9BUF7 120 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDST4Q9H3R1 872 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 MROH8Q9H579 483 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPR108Q9NPR9 543 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPS10P5Q9NQ39 176 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 STON1Q9Y6Q2 735 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLIC2O15247 247 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNHIT1O43257 154 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHV4-39P01824 125 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 MMP2P08253 660 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 SETSIPP0DME0 302 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 EDN2P20800 178 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 BLMHQ13867 455 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF234Q14588 700 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM187Q14656 261 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT24Q2M2I5 525 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM35AQ53FP2 167 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR7E24Q6IFN5 339 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 C17orf99Q6UX52 265 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 BEST2Q8NFU1 509 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR52I2Q8NH67 350 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAAR8Q969N4 342 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINGO1Q96FE5 620 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCRN2Q96FV2 425 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD180Q99467 661 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDK19Q9BWU1 502 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 BPIFA1Q9NP55 256 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNTG1Q9NSN8 517 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM202A6NGA9 273 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYNGR3O43761 229 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 DPEP1P16444 411 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNB3P16520 340 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 POU1F1P28069 291 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAD23BP54727 409 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITGA9Q13797 1035 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC38Q502W7 563 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMTC1Q8IUR5 882 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF440Q8IYI8 595 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPPL3Q8TCT6 385 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 THAP4Q8WY91 577 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM190Q8WZ59 177 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIGTQ969N2 578 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCYT2Q99447 389 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 VGLL1Q99990 258 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLSTN3Q9BQT9 956 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARNT2Q9HBZ2 717 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAGEE1Q9HCI5 957 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 PEMTQ9UBM1 199 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRHPRQ9UBQ7 328 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 TK1P04183 234 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD48P09326 243 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERVK-10P10266 1014 aa2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms