RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SULT2A1Q06520 285 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 DLG1Q12959 904 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 DPYSQ14117 519 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 LRRC32Q14392 662 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TRIP10Q15642 601 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF394Q53GI3 561 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CFAP157Q5JU67 520 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MROH9Q5TGP6 573 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SLC26A9Q7LBE3 791 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 STRADAQ7RTN6 431 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 UNC93AQ86WB7 457 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PGAM4Q8N0Y7 254 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CNTD1Q8N815 330 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SLC26A7Q8TE54 656 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TWNKQ96RR1 684 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 APOL6Q9BWW8 343 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CDT1Q9H211 546 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HESX1Q9UBX0 185 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 USP3Q9Y6I4 520 aa7.25□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 A0A1B0GTL3 188 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MATN2O00339 956 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 VILLO15195 856 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CCL16O15467 120 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TIMM44O43615 452 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SH3BP5O60239 455 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM13O60858 407 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CLPTM1O96005 669 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 URODP06132 367 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 POLBP06746 335 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 COL6A2P12110 1019 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CR2P20023 1033 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CYP3A5P20815 502 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 GDI1P31150 447 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SPRP35270 261 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 IL12RB1P42701 662 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 LIMK2P53671 638 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HDAC4P56524 1084 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TUBA4AP68366 448 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 RBP5P82980 135 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TLR1Q15399 786 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PIGGQ5H8A4 983 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 LPCAT4Q643R3 524 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 OR6B2Q6IFH4 312 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF410Q86VK4 478 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MPP5Q8N3R9 675 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HDDC3Q8N4P3 179 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 KYQ8NBH2 561 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 RIN3Q8TB24 985 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SLC35F5Q8WV83 523 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HTR3CQ8WXA8 447 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 B3GALT6Q96L58 329 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CATSPER2Q96P56 530 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HHIPQ96QV1 700 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 OSMRQ99650 979 aa7.24□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 RBBP8Q99708 897 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms