RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	IL16	Q14005	1332 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	USP32	Q8NFA0	1604 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	ARHGEF10	O15013	1369 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	EBAG9	O00559	213 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	ASAP2	O43150	1006 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	KCNAB3	O43448	404 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	LDB2	O43679	373 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	MBD3	O95983	291 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	HOXC6	P09630	235 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC175	P0C221	793 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	PTPN2	P17706	415 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	PRPH	P41219	470 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	CDH15	P55291	814 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	DSC1	Q08554	894 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	GRIK3	Q13003	919 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	GPR68	Q15743	365 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	TBATA	Q96M53	351 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	CDT1	Q9H211	546 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331		E9PCH4	1651 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	TECPR2	O15040	1411 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	ATP10D	Q9P241	1426 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331		A0A1B0GVT2	93 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	CHL1	O00533	1208 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	TOMM70	O94826	608 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	NAGA	P17050	411 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	DCTD	P32321	178 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	ACTN2	P35609	894 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	LIFR	P42702	1097 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	TRPC1	P48995	793 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	THBS3	P49746	956 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	PMS2	P54278	862 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GFM2-208	ENST00000513331	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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