RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRC66Q68CR7 880 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALG1LQ6GMV1 187 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOXR1Q6PIV2 292 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNGA4Q8IV77 575 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR156Q8NFN8 814 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCL4L1Q8NHW4 92 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HDAC11Q96DB2 347 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LGMNQ99538 433 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD84Q9UIB8 345 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RABGEF1Q9UJ41 708 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HEY1Q9Y5J3 304 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0J9YYE9 177 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 B4DGG1 531 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DXOO77932 396 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 JCHAINP01591 159 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRBC1P01850 177 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HLA-DQB2P05538 268 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEACAM5P06731 702 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR1P46091 355 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCL7P80098 99 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NIPAL4Q0D2K0 466 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IHHQ14623 411 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OGFOD3Q6PK18 319 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RFLNAQ6ZTI6 216 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF248Q8NDW4 579 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARRDC2Q8TBH0 407 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AP2M1Q96CW1 435 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNK1O00180 336 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTA2O94776 668 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNNT1P13805 278 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF30P17039 623 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNPDA1P46926 289 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERVPABLB-1P60509 514 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTSQ03393 145 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DPTQ07507 201 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LPCAT1Q8NF37 534 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCG8Q9H221 673 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDH9Q9HC56 1237 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 THSD1Q9NS62 852 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNPEPQ9ULA0 475 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF26BQ2KJY2 2108 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APOL1O14791 398 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOBOXO60393 691 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRT1P04264 644 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GLB1P16278 677 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TEAD1P28347 426 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLD2P49005 469 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C14orf28Q4W4Y0 310 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DOK6Q6PKX4 331 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SFTPA2Q8IWL1 248 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLD5Q8N7P1 536 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GSDMCQ9BYG8 508 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRN3Q9H3W5 708 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASCL3Q9NQ33 180 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUFUQ9UMX1 484 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAPN8A6NHC0 703 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF487B1APH4 448 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FUCA1P04066 466 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD86P42081 329 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPL26P61254 145 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AP1B1Q10567 949 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CERCAMQ5T4B2 595 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RFX6Q8HWS3 928 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCNJLQ8IV13 435 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPACA3Q8IXA5 215 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPBAR1Q8TDU6 330 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCAMP4Q969E2 229 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HIC2Q96JB3 615 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC46A1Q96NT5 459 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM5Q9C035 493 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EPB41L5Q9HCM4 733 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRIT1Q9P2V4 623 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INTUQ9ULD6 942 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HYOU1Q9Y4L1 999 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGSF10Q6WRI0 2623 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC187A0A096LP49 1063 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A1W2PQM1 296 aa23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms