RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HMGCLL1Q8TB92 370 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRGUKQ96M69 825 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPR78Q96P69 363 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HAPLN3Q96S86 360 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPR22Q99680 433 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTPN18Q99952 460 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LGR4Q9BXB1 951 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VCX3BQ9H321 246 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MROH8Q9H579 483 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DERAQ9Y315 318 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C7orf72A4D263 438 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DFFAO00273 331 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTGESO14684 152 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CYP2C9P11712 490 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PGFP49763 221 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CSRP3P50461 194 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DAOAP59103 153 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ART3Q13508 389 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LAMB3Q13751 1172 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RGMBQ6NW40 437 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF410Q86VK4 478 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IPMKQ8NFU5 416 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 STYXQ8WUJ0 223 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TEKT5Q96M29 485 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CHST12Q9NRB3 414 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADA2Q9NZK5 511 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDYLQ9Y232 598 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NRCAMQ92823 1304 aa6.61□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 E7ENX8 843 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 H3BSA7 217 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCL22O00626 93 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SDHDO14521 159 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ACOT8O14734 319 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TIMM44O43615 452 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DDHD2O94830 711 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLPTM1O96005 669 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DRD2P14416 443 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ME2P23368 584 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCSK6P29122 969 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TAS2R39P59534 338 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DGKDQ16760 1214 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SV2CQ496J9 727 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C16orf89Q6UX73 402 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCED1BQ96HM7 432 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CNDP1Q96KN2 507 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TNIP3Q96KP6 325 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BTBD9Q96Q07 612 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.6□□□□□ -1.35
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WDCPQ9H6R7 721 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms