RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUP188Q5SRE5 1749 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 RTL9Q8NET4 1388 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR6C68A6NDL8 312 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 USP27XA6NNY8 438 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 C17orf100A8MU93 164 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 B4E171 279 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 SNAP23O00161 211 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 RHODO00212 210 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 TULP2O00295 520 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 IKBKBO14920 756 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 PER2O15055 1255 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 CTAGE5O15320 804 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 INSIG1O15503 277 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLU7O95391 586 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 BAG3O95817 575 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 TBX18O95935 607 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 SERPINB2P05120 415 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 LDHCP07864 332 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 CHRM4P08173 479 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLRC2P26717 231 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 TSPAN7P41732 249 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 GSTO1P78417 241 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCZ1BP86790 482 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 GRAPQ13588 217 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRIM29Q14134 588 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTPN14Q15678 1187 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC18A3Q16572 532 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRTGQ2VWP7 1150 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM268Q5VZI3 342 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 MON1AQ86VX9 555 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC25Q86WR0 208 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMTC2Q8N394 836 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM199Q8N511 208 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC44A5Q8NCS7 719 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 SETD9Q8NE22 299 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 TNIP2Q8NFZ5 429 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAB40AQ8WXH6 277 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 HSPH1Q92598 858 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 NLRP4Q96MN2 994 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 PIMREGQ9BSJ6 248 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF446Q9NWS9 450 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 CLIP2Q9UDT6 1046 aa4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 NRAPQ86VF7 1730 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 CARMIL3Q8ND23 1372 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM90A10PA6NDY2 464 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPTLC2O15270 562 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 KCNAB3O43448 404 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 CEP104O60308 925 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 PFKFB2O60825 505 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 BBOX1O75936 387 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 DDAH2O95865 285 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 IL1AP01583 271 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 SKILP12757 684 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTPN9P43378 593 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC20A2Q08357 652 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 PMPCAQ10713 525 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 WTAPQ15007 396 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 ALX1Q15699 326 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMTNL2Q2TAL5 461 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 PLK5Q496M5 336 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 ALG10Q5BKT4 473 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF766Q5HY98 468 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM180BQ6P0A1 224 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAAF1Q8NEP3 725 aa4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms