RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CAPN14A8MX76 684 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 G3V2L1 256 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 LINC01565O15544 149 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PIRTP0C851 137 aa7.04□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 MPSTP25325 297 aa7.04□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 CEP97Q8IW35 865 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CFAP52Q8N1V2 620 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 PSMG2Q969U7 264 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 ELMO2Q96JJ3 720 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 TSNARE1Q96NA8 513 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 TSGA13Q96PP4 275 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 KIFC1Q9BW19 673 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 POMKQ9H5K3 350 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 TLE6Q9H808 572 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SP110Q9HB58 689 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 FIS1Q9Y3D6 152 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 TRIM13O60858 407 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SIN3BO75182 1162 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SERPINA6P08185 405 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 GRK2P25098 689 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 YWHAQP27348 245 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 ARNTP27540 789 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SLC1A2P43004 574 aa7.03□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 FUT10Q6P4F1 479 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 FAM136AQ96C01 138 aa7.03□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 RHOJQ9H4E5 214 aa7.03□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 MPOP05164 745 aa7.03□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 CD1EP15812 388 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 TAS2R39P59534 338 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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HERC4-211ENST00000492996 TEAD4Q15561 434 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 WASHC2DQ5SRD0 308 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 STXBP5Q5T5C0 1151 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 MARC1Q5VT66 337 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 IL31Q6EBC2 164 aa7.03□□□□□ -1.28
HERC4-211ENST00000492996 FBXL22Q6P050 247 aa7.03□□□□□ -1.28
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