RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491592.1

RTN4-215, Transcript of reticulon 4, human

TSL 2

Gene RTN4, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTN4-215	ENST00000491592	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	UTY	O14607	1347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	FLT4	P35916	1363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592		A0A0D9SFI3	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592		A0A1B0GVL5	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592		A0A1W2PRV1	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ASNA1	O43681	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	BUB1	O43683	1085 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	FTCD	O95954	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MT-ND5	P03915	603 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CYP1A2	P05177	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PRKCB	P05771	671 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ACVR2A	P27037	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TM4SF1	P30408	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MAP2K2	P36507	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PGM1	P36871	562 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SYK	P43405	635 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ABCG1	P45844	678 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	NDUFA8	P51970	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PRKAA2	P54646	552 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	RCN2	Q14257	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TCTE1	Q5JU00	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592		Q6YL49	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SCML4	Q8N228	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592		Q96MF0	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SH3GL2	Q99962	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	NACA2	Q9H009	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PTPRU	Q92729	1446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	PEAK1	Q9H792	1746 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SLIT1	O75093	1534 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	MRC1	P22897	1456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	COL15A1	P39059	1388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592		A4D1N5	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592		H7C4K7	107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	FCHO1	O14526	889 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RTN4-215	ENST00000491592	ERLIN2	O94905	339 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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