RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 JUNDP17535 347 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 PSMB4P28070 264 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 THOP1P52888 689 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 WNT3AP56704 352 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 RPL26P61254 145 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 FOXC1Q12948 553 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ARHGEF7Q14155 803 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 NFATC4Q14934 902 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ENPP7Q6UWV6 458 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 PRUNE1Q86TP1 453 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 SFTPA2Q8IWL1 248 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC25A41Q8N5S1 370 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 IFT43Q96FT9 208 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 GBA3Q9H227 469 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ST14Q9Y5Y6 855 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 USP27XA6NNY8 438 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 PSMD11O00231 422 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 AGTP01019 485 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 POLD2P49005 469 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC14A2Q15849 920 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 PROX2Q3B8N5 592 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 SIRPB2Q5JXA9 342 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 TRIM74Q86UV6 250 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 HEATR4Q86WZ0 1026 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 LMX1AQ8TE12 382 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 TEX101Q9BY14 249 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 RSPH14Q9UHP6 348 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 BPTFQ12830 3046 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 FADS2P1A8MWK0 482 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 YKT6O15498 198 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 METTL18O95568 372 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 NDST3O95803 873 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 TSHRP16473 764 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 CXCR5P32302 372 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 CA5AP35218 305 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 SPINT3P49223 89 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 PTPRCAPQ14761 206 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 RPS6KA1Q15418 735 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 DEFB133Q30KQ1 61 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 PRRT3Q5FWE3 981 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 HID1Q8IV36 788 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM71DQ8N9W8 422 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 GPR26Q8NDV2 337 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 IPMKQ8NFU5 416 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 CCL4L1Q8NHW4 92 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 WDR92Q96MX6 357 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 VAT1Q99536 393 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 APOL2Q9BQE5 337 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 KLK13Q9UKR3 277 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF711Q9Y462 761 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 AKAP13Q12802 2813 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 GOLGA6CA6NDK9 693 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 GOLGA6BA6NDN3 693 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ENC1O14682 589 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 MTSS1O43312 755 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 AQP9O43315 295 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 TNFSF14O43557 240 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 CEACAM5P06731 702 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 GOLGA6DP0CG33 693 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ETS1P14921 441 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF30P17039 623 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ADRA1AP35348 466 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 ACADVLP49748 655 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 HK3P52790 923 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 KIAA1024LP59773 190 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 SRP54P61011 504 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 CDK3Q00526 305 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 PPARDQ03181 441 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 DPTQ07507 201 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 PTK2BQ14289 1009 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 SPARCL1Q14515 664 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRVP-202ENST00000490575 FAXCQ5TGI0 409 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms