RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 PCDHGB4Q9UN71 923 aa5.08□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 ERVK-11Q9UQG0 969 aa5.08□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.08□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa5.08□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 A8MZ25 164 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 H3BNX3 289 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 H7C0S8 307 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 WNT9BO14905 357 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 HCRTR2O43614 444 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 TBCAO75347 108 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 IL7RP16871 459 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 KCNJ4P48050 445 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 PMS2P54278 862 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 CREB5Q02930 508 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 NAE1Q13564 534 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 RASA2Q15283 850 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 LEXMQ3ZCV2 418 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 MTSS1LQ765P7 747 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 TICAM1Q8IUC6 712 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 ADGRF2Q8IZF7 708 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 NCAPGQ9BPX3 1015 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 MXD3Q9BW11 206 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 PDZD7Q9H5P4 517 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 OR6C3Q9NZP0 311 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 FZD10Q9ULW2 581 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 SQORQ9Y6N5 450 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 SESN1Q9Y6P5 492 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 STON1Q9Y6Q2 735 aa5.07□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 A0A1B0GVM2 712 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 AGAP14A8MT82 685 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 RGS14O43566 566 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 TOMM40O96008 361 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 CLTBP09497 229 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 CSH1P0DML2 217 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 CSH2P0DML3 217 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 UBA7P41226 1012 aa5.06□□□□□ -1.6
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CCL20-204ENST00000489160 RAD23BP54727 409 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 CDH8P55286 799 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 NLRP5P59047 1200 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 GPS2Q13227 327 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 ACVR2BQ13705 512 aa5.06□□□□□ -1.6
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CCL20-204ENST00000489160 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 DUSP28Q4G0W2 176 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 HECTD3Q5T447 861 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 CHST9Q7L1S5 443 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 SHFQ7M4L6 423 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 AADATQ8N5Z0 425 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 AFAP1L1Q8TED9 768 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 PGAM5Q96HS1 289 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 HARBI1Q96MB7 349 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
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CCL20-204ENST00000489160 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.06□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 OR6C75A6NL08 312 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 TIMM23O14925 209 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 OR2C1O95371 312 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 VNN2O95498 520 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 HSPA4LO95757 839 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 FAM90A13PP0C7W8 464 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 FAM90A24PP0C7X0 464 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 DDX5P17844 614 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 MCM3P25205 808 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 PIGAP37287 484 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 NNMTP40261 264 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 GARSP41250 739 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 PIK3CAP42336 1068 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 PGGT1BP53609 377 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 TFAP4Q01664 338 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 MMEL1Q495T6 779 aa5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CCL20-204ENST00000489160 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.05□□□□□ -1.6
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